62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0388 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0388  cobalt ABC transporter permease  100 
 
 
304 aa  596  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.290241  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04431  cobalt ABC transporter permease  92.76 
 
 
304 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04121  cobalt ABC transporter permease  93.09 
 
 
304 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0888623  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04541  cobalt ABC transporter permease  76.64 
 
 
304 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.727221  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04441  cobalt ABC transporter permease  48.18 
 
 
304 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0555726  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1727  cobalt ABC transporter permease  47.85 
 
 
304 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.856144  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2027  cobalt ABC transporter permease  43.09 
 
 
302 aa  237  2e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03891  cobalt ABC transporter permease  45.87 
 
 
305 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21501  cobalt ABC transporter permease  44.41 
 
 
304 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0645  cobalt ABC transporter permease  44.08 
 
 
302 aa  221  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.706305  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2867  cobalt transport protein  36.61 
 
 
290 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1229  cobalt transport protein  36.69 
 
 
322 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.379694 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3229  cobalt transport protein  36.61 
 
 
290 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.500857 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0884  cobalt transport protein  39.61 
 
 
291 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2897  cobalt transport protein  35.74 
 
 
308 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00540411  hitchhiker  0.000146213 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2341  cobalt transport system permease protein  35.25 
 
 
293 aa  141  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112211  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4901  cobalt transport protein  36.77 
 
 
334 aa  132  6e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.703439  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3565  cobalt transport protein  34.53 
 
 
309 aa  130  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0616568  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_4931  ABC(membrane) family transporter: cobalt ion  27.24 
 
 
257 aa  100  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  32.58 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  25 
 
 
268 aa  63.5  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  25.34 
 
 
266 aa  63.5  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  25 
 
 
268 aa  62.8  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  30.05 
 
 
264 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  30.05 
 
 
264 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  30.05 
 
 
264 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  30.05 
 
 
264 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  30.05 
 
 
264 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  30.05 
 
 
264 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  30.05 
 
 
264 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  29.51 
 
 
264 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  28.96 
 
 
264 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  30.05 
 
 
264 aa  60.8  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  26.39 
 
 
269 aa  60.1  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0629  cobalt transport protein  29.32 
 
 
438 aa  59.3  0.00000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.35082  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  28.24 
 
 
268 aa  59.3  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  26.57 
 
 
267 aa  59.3  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  29.91 
 
 
263 aa  58.5  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  29.91 
 
 
263 aa  58.5  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  23.62 
 
 
267 aa  58.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  28.48 
 
 
267 aa  57  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  27.32 
 
 
264 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1947  cobalt ABC transporter permease protein  31.25 
 
 
259 aa  55.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.259406  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1702  cobalt transport protein  23.75 
 
 
265 aa  54.3  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  21.01 
 
 
264 aa  53.5  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  27.17 
 
 
265 aa  52.8  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  27.17 
 
 
265 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  33.33 
 
 
265 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  24.83 
 
 
270 aa  50.4  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  33.96 
 
 
262 aa  50.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  25.27 
 
 
332 aa  49.3  0.00008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  22.78 
 
 
269 aa  49.3  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0318  cobalt transport protein  22.35 
 
 
262 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000082775  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf374  cobalt ABC transporter, permease protein  23 
 
 
314 aa  46.2  0.0007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004205  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2470  cobalt transport protein  25.77 
 
 
275 aa  46.2  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105266  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  25.76 
 
 
268 aa  44.3  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  33.77 
 
 
267 aa  44.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0320  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  29.36 
 
 
267 aa  44.3  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00398229  hitchhiker  1.85295e-17 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  23.57 
 
 
269 aa  43.5  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2799  cobalt transport protein  24.05 
 
 
284 aa  43.5  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161091  hitchhiker  0.0000401783 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2300  cobalt ABC transporter permease protein  34.15 
 
 
263 aa  43.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000489641  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  29.55 
 
 
266 aa  42.7  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>