65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2027 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2027  cobalt ABC transporter permease  100 
 
 
302 aa  569  1e-161  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0645  cobalt ABC transporter permease  81.13 
 
 
302 aa  404  1e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.706305  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21501  cobalt ABC transporter permease  70.72 
 
 
304 aa  341  9e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04441  cobalt ABC transporter permease  54.61 
 
 
304 aa  305  5.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0555726  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1727  cobalt ABC transporter permease  54.61 
 
 
304 aa  305  7e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.856144  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03891  cobalt ABC transporter permease  56.68 
 
 
305 aa  295  5e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04541  cobalt ABC transporter permease  44.74 
 
 
304 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.727221  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04431  cobalt ABC transporter permease  42.43 
 
 
304 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0388  cobalt ABC transporter permease  43.09 
 
 
304 aa  236  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.290241  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04121  cobalt ABC transporter permease  42.43 
 
 
304 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0888623  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1229  cobalt transport protein  36.33 
 
 
322 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.379694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2867  cobalt transport protein  37.55 
 
 
290 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2341  cobalt transport system permease protein  38.87 
 
 
293 aa  159  6e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112211  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3229  cobalt transport protein  37.55 
 
 
290 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.500857 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0884  cobalt transport protein  39.85 
 
 
291 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2897  cobalt transport protein  36.66 
 
 
308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00540411  hitchhiker  0.000146213 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4901  cobalt transport protein  34.47 
 
 
334 aa  130  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.703439  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3565  cobalt transport protein  35.86 
 
 
309 aa  131  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0616568  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_4931  ABC(membrane) family transporter: cobalt ion  33.33 
 
 
257 aa  101  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  32.64 
 
 
266 aa  67  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  28.63 
 
 
264 aa  58.5  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf374  cobalt ABC transporter, permease protein  22.73 
 
 
314 aa  55.8  0.0000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004205  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  20.8 
 
 
268 aa  55.8  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  22.91 
 
 
270 aa  55.8  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  21.68 
 
 
268 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  25.89 
 
 
269 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  27.87 
 
 
267 aa  54.3  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  24.43 
 
 
262 aa  53.1  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  21.56 
 
 
267 aa  52.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1947  cobalt ABC transporter permease protein  28.67 
 
 
259 aa  52  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.259406  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  24.25 
 
 
264 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  26.67 
 
 
263 aa  51.2  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  26.67 
 
 
263 aa  51.2  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0318  cobalt transport protein  26.43 
 
 
262 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000082775  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  25.76 
 
 
332 aa  50.1  0.00005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  24.43 
 
 
268 aa  49.7  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  28.87 
 
 
265 aa  49.7  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  23.88 
 
 
264 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  27.34 
 
 
268 aa  49.3  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  27.34 
 
 
268 aa  49.3  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  25.33 
 
 
268 aa  48.9  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  21.13 
 
 
264 aa  48.9  0.00009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  22.76 
 
 
264 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  22.76 
 
 
264 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1693  cobalt transport protein  26.98 
 
 
265 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0637761  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  22.76 
 
 
264 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  22.76 
 
 
264 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  22.76 
 
 
264 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  22.76 
 
 
264 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0629  cobalt transport protein  28.19 
 
 
438 aa  48.1  0.0002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.35082  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0247  cobalt transport protein  34.06 
 
 
269 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.224698  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  27.84 
 
 
265 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  22.76 
 
 
264 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1950  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporters-like protein  28.89 
 
 
241 aa  47.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0666  cobalt ABC transporter, permease protein  30.61 
 
 
336 aa  47.4  0.0003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  22.22 
 
 
264 aa  47  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  23.88 
 
 
264 aa  47  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2470  cobalt transport protein  23.71 
 
 
275 aa  47  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105266  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1702  cobalt transport protein  24.43 
 
 
265 aa  46.6  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  24.45 
 
 
267 aa  45.4  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2300  cobalt ABC transporter permease protein  34.95 
 
 
263 aa  43.9  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000489641  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  25.67 
 
 
269 aa  44.3  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  24.72 
 
 
267 aa  43.5  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1194  putative biotin ABC transporter, permease protein  23.02 
 
 
217 aa  43.5  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  28.81 
 
 
265 aa  42.4  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>