286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2124 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  100 
 
 
266 aa  505  9.999999999999999e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  44.4 
 
 
268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  44.4 
 
 
268 aa  243  3e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  44.62 
 
 
267 aa  239  4e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  46.22 
 
 
268 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  44.49 
 
 
267 aa  229  4e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  49.37 
 
 
265 aa  228  8e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  44.81 
 
 
269 aa  228  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  49 
 
 
263 aa  226  3e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  49 
 
 
263 aa  226  3e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  44.63 
 
 
265 aa  221  9e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  49.19 
 
 
269 aa  211  9e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  42.8 
 
 
270 aa  209  3e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  49.39 
 
 
265 aa  206  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  41.8 
 
 
262 aa  205  5e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  40.48 
 
 
264 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  40.48 
 
 
264 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  40.48 
 
 
264 aa  203  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  41.87 
 
 
264 aa  203  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  41.06 
 
 
264 aa  202  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  40.08 
 
 
264 aa  202  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  40.08 
 
 
264 aa  202  5e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  40.08 
 
 
264 aa  202  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  40.08 
 
 
264 aa  202  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  40.08 
 
 
264 aa  202  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  40.65 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  41.08 
 
 
266 aa  199  3e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  39.6 
 
 
266 aa  199  3e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  37.5 
 
 
268 aa  199  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  37.5 
 
 
268 aa  199  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0318  cobalt transport protein  39.13 
 
 
262 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000082775  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  38.17 
 
 
268 aa  190  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  39.43 
 
 
264 aa  190  2e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  41.08 
 
 
264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  36.72 
 
 
267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0247  cobalt transport protein  43.08 
 
 
269 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.224698  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  37.3 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  44.05 
 
 
264 aa  179  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1947  cobalt ABC transporter permease protein  40.08 
 
 
259 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.259406  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  37.3 
 
 
267 aa  171  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0320  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  38.1 
 
 
267 aa  167  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00398229  hitchhiker  1.85295e-17 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12580  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  41.25 
 
 
269 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  34.5 
 
 
263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24080  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  39.75 
 
 
266 aa  161  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1702  cobalt transport protein  38.11 
 
 
265 aa  157  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0828  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  33.48 
 
 
255 aa  154  1e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.404494  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2470  cobalt transport protein  41.18 
 
 
275 aa  152  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105266  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0997  cobalt transport protein  42.8 
 
 
264 aa  152  5.9999999999999996e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  normal  0.445886 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0666  cobalt ABC transporter, permease protein  28.37 
 
 
336 aa  151  1e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0929  cobalt transport protein  36.29 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000291148  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2300  cobalt ABC transporter permease protein  39.61 
 
 
263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000489641  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0629  cobalt transport protein  37.93 
 
 
438 aa  145  9e-34  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.35082  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0951  cobalt transport protein  36.29 
 
 
271 aa  144  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.222726  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  29.82 
 
 
332 aa  143  3e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0352  cobalt transport protein  34.55 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0077  cobalt transport protein  30.52 
 
 
246 aa  141  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.67532  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2799  cobalt transport protein  40.57 
 
 
284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161091  hitchhiker  0.0000401783 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  37.02 
 
 
810 aa  139  3e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  30.89 
 
 
269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf374  cobalt ABC transporter, permease protein  31.05 
 
 
314 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004205  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1836  cobalt transport protein  29.63 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.507525  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0583  cobalt transport family protein  38.62 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  28.99 
 
 
770 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3887  cobalt transport protein  33.33 
 
 
270 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000020913  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  28.34 
 
 
257 aa  102  5e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2822  cobalt transport protein  30.51 
 
 
261 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1302  cobalt transport protein  34.24 
 
 
267 aa  100  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0789486  normal  0.0436887 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1608  cobalt transport protein  29.34 
 
 
262 aa  99.4  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01470  Cobalt transport protein  27.11 
 
 
350 aa  97.4  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0260035  normal  0.244881 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0027  hypothetical protein  32.78 
 
 
255 aa  97.1  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19680  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  41.18 
 
 
231 aa  95.5  8e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0554754  normal  0.221391 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1964  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit  30.08 
 
 
255 aa  95.1  9e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0884  cobalt transport protein  28.62 
 
 
291 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12800  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  29.46 
 
 
256 aa  90.1  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0712  cobalt transport protein  30.42 
 
 
243 aa  89.4  5e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2867  cobalt transport protein  29.3 
 
 
290 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3565  cobalt transport protein  31.82 
 
 
309 aa  88.2  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0616568  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3229  cobalt transport protein  29.3 
 
 
290 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.500857 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2897  cobalt transport protein  26.71 
 
 
308 aa  87  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00540411  hitchhiker  0.000146213 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3660  cobalt transport protein  30.14 
 
 
196 aa  86.7  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2485  cobalt transport protein  33.72 
 
 
256 aa  86.7  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.08544  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1194  putative biotin ABC transporter, permease protein  26.75 
 
 
217 aa  85.5  8e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3551  cobalt ABC transporter, permease protein  29.21 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401892  normal  0.225242 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0226  cobalt transport protein  31.18 
 
 
262 aa  84  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1879  cobalt transport protein  24.69 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.200735  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1229  cobalt transport protein  34.51 
 
 
322 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.379694 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0598  cobalt transport protein  32.1 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157547  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3473  cobalt transport protein  29.49 
 
 
259 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1768  ABC transporter, permease protein  26.3 
 
 
297 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.689624  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1751  cobalt transport protein  30.4 
 
 
272 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253796  normal  0.0321598 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1730  cobalt transport protein  34.22 
 
 
200 aa  79.7  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1693  cobalt transport protein  30.07 
 
 
265 aa  78.6  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0637761  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1130  cobalt transport protein  32.43 
 
 
258 aa  78.6  0.00000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0337  cobalt transport protein  28.8 
 
 
256 aa  78.6  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3226  cobalt transport protein  32.14 
 
 
200 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  27.24 
 
 
310 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07620  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  32.93 
 
 
276 aa  75.5  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  27.38 
 
 
259 aa  75.1  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4125  cobalt transport protein  37.13 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.902173  hitchhiker  0.0000589617 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3823  cobalt transport protein  35.23 
 
 
266 aa  72.4  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457934  normal  0.0215821 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>