194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0583 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0583  cobalt transport family protein  100 
 
 
257 aa  503  9.999999999999999e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1964  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit  42.19 
 
 
255 aa  203  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  35.83 
 
 
263 aa  145  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  35.83 
 
 
263 aa  145  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  31.54 
 
 
269 aa  142  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  35 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  34.24 
 
 
268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  35.22 
 
 
264 aa  139  6e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  35.8 
 
 
268 aa  138  7e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  35.57 
 
 
266 aa  138  7e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  35.39 
 
 
268 aa  138  8.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  34.41 
 
 
264 aa  137  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  34.82 
 
 
264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  34.41 
 
 
264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  34.82 
 
 
264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  34.01 
 
 
264 aa  136  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  34.01 
 
 
264 aa  136  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  34.01 
 
 
264 aa  136  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  34.01 
 
 
264 aa  136  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  34.01 
 
 
264 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  36.64 
 
 
264 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  35.56 
 
 
266 aa  135  7.000000000000001e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  36.71 
 
 
265 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  34.01 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  31.64 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  37.65 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  38.33 
 
 
265 aa  132  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  35.18 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2300  cobalt ABC transporter permease protein  36.96 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000489641  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  38.4 
 
 
264 aa  130  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0318  cobalt transport protein  33.47 
 
 
262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000082775  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  30.59 
 
 
270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  32.64 
 
 
267 aa  123  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  38.43 
 
 
266 aa  123  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  32.55 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  34.63 
 
 
264 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  32.14 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1836  cobalt transport protein  31.22 
 
 
244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.507525  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1702  cobalt transport protein  35.16 
 
 
265 aa  115  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0247  cobalt transport protein  34.38 
 
 
269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.224698  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0077  cobalt transport protein  30.74 
 
 
246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.67532  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  33.47 
 
 
267 aa  112  5e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  30.13 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0320  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  34.57 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00398229  hitchhiker  1.85295e-17 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0997  cobalt transport protein  33.88 
 
 
264 aa  109  5e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  normal  0.445886 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  30.13 
 
 
268 aa  109  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  30.13 
 
 
268 aa  109  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1947  cobalt ABC transporter permease protein  29.8 
 
 
259 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.259406  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3660  cobalt transport protein  31.94 
 
 
196 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  29.37 
 
 
263 aa  100  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  26.48 
 
 
332 aa  95.1  1e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1194  putative biotin ABC transporter, permease protein  27.4 
 
 
217 aa  92.4  6e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.91 
 
 
770 aa  91.3  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2470  cobalt transport protein  30.2 
 
 
275 aa  90.1  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105266  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  30.8 
 
 
269 aa  89.4  6e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1751  cobalt transport protein  30.94 
 
 
272 aa  89  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253796  normal  0.0321598 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0951  cobalt transport protein  27.76 
 
 
271 aa  85.9  6e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.222726  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0929  cobalt transport protein  28.83 
 
 
271 aa  85.9  6e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000291148  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12580  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  29.69 
 
 
269 aa  85.5  8e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24080  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  29.3 
 
 
266 aa  85.1  9e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2799  cobalt transport protein  28.69 
 
 
284 aa  82.4  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161091  hitchhiker  0.0000401783 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0828  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  26.89 
 
 
255 aa  79.7  0.00000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.404494  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0666  cobalt ABC transporter, permease protein  25.25 
 
 
336 aa  78.2  0.0000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3687  cobalt transport protein  28.24 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  26.19 
 
 
810 aa  74.3  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19680  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  25.88 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0554754  normal  0.221391 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3687  cobalt transport protein  29.77 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.600557  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0629  cobalt transport protein  30.95 
 
 
438 aa  70.1  0.00000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.35082  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf374  cobalt ABC transporter, permease protein  26.35 
 
 
314 aa  69.3  0.00000000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004205  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3551  cobalt ABC transporter, permease protein  26.49 
 
 
287 aa  68.9  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401892  normal  0.225242 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1693  cobalt transport protein  28.08 
 
 
265 aa  68.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0637761  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1000  cobalt transport protein  27.91 
 
 
260 aa  67  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000433995  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  25.61 
 
 
257 aa  67  0.0000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3288  cobalt transport protein  35.11 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.972587  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1608  cobalt transport protein  26.51 
 
 
262 aa  65.1  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1067  cobalt transport protein  30.39 
 
 
255 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2111  cobalt transport protein  29.67 
 
 
253 aa  65.1  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.105406  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3887  cobalt transport protein  26.86 
 
 
270 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000020913  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1229  cobalt transport protein  30.56 
 
 
322 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.379694 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2312  putative cobalt transport system permease protein  26.61 
 
 
198 aa  64.3  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1760  cobalt transport protein  23.76 
 
 
291 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1950  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporters-like protein  26.72 
 
 
241 aa  64.3  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1788  cobalt transport protein  23.76 
 
 
291 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.121417  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3139  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.66 
 
 
255 aa  62.8  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.122579  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5458  cobalt transport protein  27.31 
 
 
201 aa  62  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00259272  normal  0.0904003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2867  cobalt transport protein  24.18 
 
 
290 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1730  cobalt transport protein  27.06 
 
 
200 aa  61.6  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3229  cobalt transport protein  24.18 
 
 
290 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.500857 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0337  cobalt transport protein  27.27 
 
 
256 aa  61.2  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0352  cobalt transport protein  26.25 
 
 
264 aa  60.8  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1302  cobalt transport protein  24.51 
 
 
267 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0789486  normal  0.0436887 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0598  cobalt transport protein  25.38 
 
 
261 aa  59.7  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157547  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1879  cobalt transport protein  26.23 
 
 
252 aa  59.3  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.200735  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0660  cobalt transport family protein  27.84 
 
 
279 aa  58.9  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.11691  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0884  cobalt transport protein  22.71 
 
 
291 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1800  cobalt transport protein  26.69 
 
 
279 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0027  hypothetical protein  27.35 
 
 
255 aa  58.2  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0847  cobalt transport protein  27.68 
 
 
302 aa  58.2  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5234  cobalt transport protein  22.91 
 
 
283 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0260  hypothetical protein  27.13 
 
 
266 aa  57.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.79252  normal  0.480643 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>