229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05107 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05107  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ  100 
 
 		 279 aa  568  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001241  transmembrane component MtsC of energizing module of methionine-regulated ECF transporter  94.27 
 
 		 279 aa  508  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529253  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1990  putative cobalt transport protein  72.4 
 
 		 279 aa  421  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024453  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1834  putative cobalt ABC transporter, permease protein  41.11 
 
 		 273 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  41.85 
 
 		 273 aa  221  9e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0348  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  41.48 
 
 		 276 aa  211  1e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1632  cobalt transport family protein  44.31 
 
 		 276 aa  207  2e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1539  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  38.04 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.173972  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07620  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  39.26 
 
 		 276 aa  203  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1972  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  40.07 
 
 		 275 aa  203  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2498  cobalt transport protein  39.69 
 
 		 266 aa  203  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2667  cobalt transport protein  38.87 
 
 		 266 aa  203  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2386  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  37.74 
 
 		 287 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00268022  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2710  cobalt transport protein  36.98 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2462  cobalt transport protein  37.74 
 
 		 287 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2642  cobalt transport protein  37.74 
 
 		 273 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.357292  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2669  cobalt transport protein  37.59 
 
 		 266 aa  192  6e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00761496  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2659  cobalt transport protein  37.36 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000035997 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1501  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  39.86 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2425  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  36.98 
 
 		 287 aa  188  7e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434651  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2657  cobalt transport protein  38.87 
 
 		 266 aa  188  9e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.287835  hitchhiker  0.000000289223 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2707  cobalt transport protein  41.74 
 
 		 277 aa  187  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2764  cobalt transport protein  41.74 
 
 		 277 aa  187  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0369  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  37.91 
 
 		 273 aa  181  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  26.74 
 
 		 310 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8786  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporter-like protein  25.29 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1535  cobalt transport protein  28.57 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.811853  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0226  cobalt transport protein  25.95 
 
 		 262 aa  82  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0260  hypothetical protein  27.45 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.79252  normal  0.480643 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1760  cobalt transport protein  27 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1788  cobalt transport protein  27 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.121417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12800  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  24.62 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2485  cobalt transport protein  30.99 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.08544  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  26.77 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  26.77 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  28.25 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  28.09 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  28.09 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2111  cobalt transport protein  33.33 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.105406  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  27.88 
 
 		 264 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  27.88 
 
 		 264 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  27.88 
 
 		 264 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  27.88 
 
 		 264 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  27.88 
 
 		 264 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  26.77 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0370  cobalt transport protein  30.61 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  29.3 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1257  cobalt transport protein  27.27 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000290738  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1894  cobalt transport protein  27.03 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.154103  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5234  cobalt transport protein  27.06 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  25.81 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  27.57 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07520  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  25.93 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.508014 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1950  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporters-like protein  30.92 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3887  cobalt transport protein  27.09 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000020913  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1879  cobalt transport protein  28.68 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.200735  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0337  cobalt transport protein  30.16 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  28.36 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  24.54 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4408  cobalt transport protein  27.91 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.371368  normal  0.0141186 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3473  cobalt transport protein  32.21 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3551  cobalt ABC transporter, permease protein  27.34 
 
 		 287 aa  67  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401892  normal  0.225242 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0712  cobalt transport protein  32.43 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  23.95 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0629  cobalt transport protein  24.23 
 
 		 438 aa  66.6  0.0000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.35082  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2677  cobalt transport protein  27.03 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.503395  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0330  cobalt transport protein  33.62 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0905  hypothetical protein  28.23 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.313677  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2704  cobalt transport protein  25.74 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  27.69 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0682  cobalt transport protein  34.58 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000924748  normal  0.134467 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1545  cobalt transport protein  27.33 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.679113  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  25.52 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  25.52 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  27.57 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3451  cobalt transport protein  25.38 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1006  ABC transporter membrane spanning protein  25.25 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  26.36 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  29.3 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0242  hypothetical protein  30.43 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  27.34 
 
 		 268 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  26.62 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  28 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  28 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3444  cobalt transport protein  23.75 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  36.9 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  26.16 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2822  cobalt transport protein  25 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1539  cobalt transport protein  23.41 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  31.82 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3139  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  22.61 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.122579  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4056  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.02 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  31.48 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3823  cobalt transport protein  22.62 
 
 		 266 aa  58.9  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457934  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0598  cobalt transport protein  23.48 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157547  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1800  cobalt transport protein  22.67 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  31.19 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  26.06 
 
 		 263 aa  57  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2799  cobalt transport protein  27.11 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161091  hitchhiker  0.0000401783 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  26.14 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>