91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0242 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0242  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  473  1e-132  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2157  ABC transporter, permease protein, putative  28.75 
 
 
237 aa  104  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000133808  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0905  hypothetical protein  32.88 
 
 
238 aa  103  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.313677  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0314  cobalt transport protein  27.59 
 
 
250 aa  94.7  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.892766  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2654  cobalt transport protein  28.9 
 
 
231 aa  89.7  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.36556  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1433  cobalt transport protein  24.64 
 
 
277 aa  89.7  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.43153  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4597  cobalt transport protein  31.37 
 
 
244 aa  88.6  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0314465 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0330  cobalt transport protein  27.39 
 
 
238 aa  88.6  9e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0283  transporter, putative  26.14 
 
 
234 aa  87.8  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1597  transporter, putative  31.41 
 
 
235 aa  87  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0420  cobalt ABC transporter permease  32.43 
 
 
233 aa  85.1  9e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0190437  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1768  cobalt transport protein  34.78 
 
 
232 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4773  cobalt transport protein  30.66 
 
 
239 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2623  hypothetical protein  32.21 
 
 
246 aa  80.5  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1604  ABC transporter, permease protein, putative  33.9 
 
 
228 aa  79  0.00000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4171  cobalt transport protein  28.77 
 
 
249 aa  78.2  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00476195  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0323  cobalt transport protein  24.66 
 
 
242 aa  78.2  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1483  cobalt transport protein  27.93 
 
 
225 aa  76.3  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25720  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  27.63 
 
 
241 aa  75.1  0.0000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2319  cobalt transport protein  25.11 
 
 
245 aa  74.3  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.945459 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0335  cobalt transport protein  28.83 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23150  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  30.88 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2306  cobalt transport protein  25.74 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0256  hypothetical protein  28.57 
 
 
232 aa  66.6  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0678  cobalt transport protein  35 
 
 
227 aa  66.2  0.0000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0899  ABC transporter, permease protein, putative  31.13 
 
 
238 aa  65.1  0.0000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0380  cobalt transport protein  25.62 
 
 
254 aa  63.9  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.709452  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0828  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  26.75 
 
 
255 aa  62  0.000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.404494  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05107  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ  30.43 
 
 
279 aa  62  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001241  transmembrane component MtsC of energizing module of methionine-regulated ECF transporter  29.78 
 
 
279 aa  61.6  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529253  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0310  hypothetical protein  22.22 
 
 
241 aa  60.5  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0573771  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1493  cobalt transport protein  28.44 
 
 
231 aa  60.5  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.192292  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00730  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  25.47 
 
 
250 aa  59.7  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.648464  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3088  cobalt transport protein  28.1 
 
 
226 aa  58.9  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  28.57 
 
 
273 aa  55.5  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1990  putative cobalt transport protein  27.85 
 
 
279 aa  54.7  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024453  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0348  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  28.93 
 
 
276 aa  54.7  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1834  putative cobalt ABC transporter, permease protein  29.91 
 
 
273 aa  53.5  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  28.23 
 
 
267 aa  50.1  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  24.77 
 
 
265 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  25 
 
 
266 aa  49.3  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  22.41 
 
 
269 aa  48.5  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2764  cobalt transport protein  25 
 
 
277 aa  47  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2707  cobalt transport protein  25 
 
 
277 aa  47  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  24.77 
 
 
264 aa  47.4  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1972  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  26.36 
 
 
275 aa  47.8  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0666  cobalt ABC transporter, permease protein  26.72 
 
 
336 aa  47  0.0002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  25 
 
 
265 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1632  cobalt transport family protein  26.79 
 
 
276 aa  46.6  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  25.69 
 
 
264 aa  46.6  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8786  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporter-like protein  28.16 
 
 
272 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0609  cobalt transport protein  25.49 
 
 
261 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  22.46 
 
 
264 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  22.27 
 
 
264 aa  45.4  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  22.46 
 
 
264 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  25.96 
 
 
266 aa  45.4  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2657  cobalt transport protein  24.11 
 
 
266 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.287835  hitchhiker  0.000000289223 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1501  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  23.08 
 
 
293 aa  45.4  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  22.46 
 
 
264 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  22.46 
 
 
264 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  26.45 
 
 
332 aa  45.1  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  22.46 
 
 
264 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2386  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  25.66 
 
 
287 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00268022  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3551  cobalt ABC transporter, permease protein  22.88 
 
 
287 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401892  normal  0.225242 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1192  cobalt ABC transporter, permease protein, putative  21.28 
 
 
254 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00889776  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  22.46 
 
 
264 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  22.22 
 
 
266 aa  44.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2498  cobalt transport protein  25.66 
 
 
266 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  22.46 
 
 
264 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  22.03 
 
 
264 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  23.26 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2667  cobalt transport protein  25.66 
 
 
266 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2425  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  25.66 
 
 
287 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434651  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0951  cobalt transport protein  28.45 
 
 
271 aa  43.9  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.222726  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  22.03 
 
 
264 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2669  cobalt transport protein  25.2 
 
 
266 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00761496  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2642  cobalt transport protein  25.66 
 
 
273 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.357292  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0929  cobalt transport protein  28.45 
 
 
271 aa  44.3  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000291148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2462  cobalt transport protein  25.66 
 
 
287 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2659  cobalt transport protein  25.66 
 
 
266 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000035997 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3101  cobalt transport protein  25.96 
 
 
233 aa  43.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.486493  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  24.27 
 
 
268 aa  42.7  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  24.27 
 
 
268 aa  42.7  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0583  cobalt transport family protein  32.93 
 
 
257 aa  42.4  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07620  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  22.56 
 
 
276 aa  42.4  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0337  cobalt transport protein  25.19 
 
 
256 aa  42  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1539  cobalt transport protein  23.3 
 
 
245 aa  42.4  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0007  cobalt transport protein  20.45 
 
 
258 aa  42.4  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2710  cobalt transport protein  24.78 
 
 
266 aa  42  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0247  cobalt transport protein  25.81 
 
 
269 aa  42  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.224698  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1006  ABC transporter membrane spanning protein  20.13 
 
 
206 aa  42  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>