64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2157 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2157  ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 		 237 aa  461  1e-129  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000133808  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0905  hypothetical protein  28.21 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.313677  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0242  hypothetical protein  28.75 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0420  cobalt ABC transporter permease  28.17 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0190437  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2654  cobalt transport protein  28.69 
 
 		 231 aa  98.2  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.36556  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0283  transporter, putative  27.13 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0314  cobalt transport protein  39.08 
 
 		 250 aa  89  6e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.892766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0335  cobalt transport protein  30.5 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1483  cobalt transport protein  30.53 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4773  cobalt transport protein  28.91 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1433  cobalt transport protein  32.11 
 
 		 277 aa  82  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.43153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4597  cobalt transport protein  21.61 
 
 		 244 aa  81.6  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0314465 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3088  cobalt transport protein  31.73 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2319  cobalt transport protein  25.11 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.945459 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1768  cobalt transport protein  24 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4171  cobalt transport protein  21.7 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00476195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23150  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  31.45 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0330  cobalt transport protein  25.4 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0256  hypothetical protein  31.37 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0899  ABC transporter, permease protein, putative  40.23 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25720  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  28.29 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2623  hypothetical protein  26.95 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1604  ABC transporter, permease protein, putative  26.89 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00730  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  32.12 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.648464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0678  cobalt transport protein  32.09 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1597  transporter, putative  28.33 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0323  cobalt transport protein  24.6 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2306  cobalt transport protein  27.59 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0380  cobalt transport protein  27.4 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.709452  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05107  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ  26.79 
 
 		 279 aa  53.9  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  27.73 
 
 		 266 aa  53.1  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  22.07 
 
 		 273 aa  52  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001241  transmembrane component MtsC of energizing module of methionine-regulated ECF transporter  25.89 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529253  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1990  putative cobalt transport protein  25.89 
 
 		 279 aa  50.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024453  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  28.44 
 
 		 266 aa  50.4  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1834  putative cobalt ABC transporter, permease protein  21.38 
 
 		 273 aa  50.1  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0337  cobalt transport protein  22.88 
 
 		 256 aa  48.9  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0712  cobalt transport protein  22.57 
 
 		 243 aa  48.5  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  25.69 
 
 		 264 aa  48.1  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3551  cobalt ABC transporter, permease protein  25.21 
 
 		 287 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401892  normal  0.225242 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1493  cobalt transport protein  20.56 
 
 		 231 aa  48.5  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.192292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0310  hypothetical protein  21.05 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0573771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1539  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  22.88 
 
 		 278 aa  47  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.173972  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0828  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  27.36 
 
 		 255 aa  46.6  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.404494  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3887  cobalt transport protein  25.49 
 
 		 270 aa  45.8  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000020913  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  29.79 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  28.32 
 
 		 269 aa  43.9  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  28.44 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  28.44 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2669  cobalt transport protein  21.99 
 
 		 266 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00761496  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1950  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporters-like protein  22.66 
 
 		 241 aa  43.5  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2386  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  21.58 
 
 		 287 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00268022  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  24.19 
 
 		 264 aa  42.7  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2710  cobalt transport protein  22.3 
 
 		 266 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3473  cobalt transport protein  22.5 
 
 		 259 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1501  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  24.19 
 
 		 293 aa  42.7  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2498  cobalt transport protein  26.14 
 
 		 266 aa  42.4  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  22.76 
 
 		 259 aa  42.4  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1879  cobalt transport protein  25.95 
 
 		 252 aa  42.4  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.200735  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2657  cobalt transport protein  20.57 
 
 		 266 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.287835  hitchhiker  0.000000289223 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1632  cobalt transport family protein  23.26 
 
 		 276 aa  42  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1302  cobalt transport protein  28.57 
 
 		 267 aa  42  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0789486  normal  0.0436887 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  24.22 
 
 		 264 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  25.69 
 
 		 264 aa  41.6  0.01  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>