59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0905 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0905  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  473  1e-132  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.313677  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2157  ABC transporter, permease protein, putative  28.21 
 
 		 237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000133808  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0242  hypothetical protein  32.88 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0283  transporter, putative  32.35 
 
 		 234 aa  102  6e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0314  cobalt transport protein  28.79 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.892766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2654  cobalt transport protein  32.13 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.36556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0330  cobalt transport protein  36.22 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1433  cobalt transport protein  27.6 
 
 		 277 aa  93.2  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.43153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0420  cobalt ABC transporter permease  29.41 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0190437  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1768  cobalt transport protein  26.42 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0380  cobalt transport protein  27.47 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.709452  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0323  cobalt transport protein  28.3 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4597  cobalt transport protein  30.83 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0314465 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0335  cobalt transport protein  31.45 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23150  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  25.49 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1483  cobalt transport protein  29.63 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1597  transporter, putative  32.43 
 
 		 235 aa  74.7  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0256  hypothetical protein  31.51 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4171  cobalt transport protein  30.48 
 
 		 249 aa  71.6  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00476195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2306  cobalt transport protein  30.83 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1604  ABC transporter, permease protein, putative  30.26 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4773  cobalt transport protein  28.93 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2319  cobalt transport protein  22.27 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.945459 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2623  hypothetical protein  27.97 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00730  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  34.92 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.648464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3088  cobalt transport protein  27.36 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05107  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ  28.23 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25720  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  28.1 
 
 		 241 aa  65.1  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0678  cobalt transport protein  28.98 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1990  putative cobalt transport protein  27.36 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024453  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2498  cobalt transport protein  27.27 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0899  ABC transporter, permease protein, putative  25.6 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001241  transmembrane component MtsC of energizing module of methionine-regulated ECF transporter  26.67 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529253  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  25.81 
 
 		 273 aa  58.5  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2657  cobalt transport protein  25.87 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.287835  hitchhiker  0.000000289223 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2667  cobalt transport protein  22.41 
 
 		 266 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0348  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  25.62 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1834  putative cobalt ABC transporter, permease protein  24.19 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0310  hypothetical protein  27.36 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0573771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07620  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  25.41 
 
 		 276 aa  54.3  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1539  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  25 
 
 		 278 aa  52  0.000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.173972  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  25 
 
 		 259 aa  52.4  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1501  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  27.5 
 
 		 293 aa  49.7  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  26.6 
 
 		 266 aa  49.3  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1493  cobalt transport protein  25.47 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.192292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0077  cobalt transport protein  32.74 
 
 		 246 aa  46.6  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.67532  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  27.4 
 
 		 268 aa  45.8  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  27.4 
 
 		 268 aa  45.8  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  22.13 
 
 		 310 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3551  cobalt ABC transporter, permease protein  23.58 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401892  normal  0.225242 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  26.73 
 
 		 267 aa  43.9  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0951  cobalt transport protein  27.68 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.222726  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  25.84 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0337  cobalt transport protein  24.56 
 
 		 256 aa  43.5  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0929  cobalt transport protein  26.79 
 
 		 271 aa  43.5  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000291148  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1788  cobalt transport protein  21.82 
 
 		 291 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.121417  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  25.98 
 
 		 268 aa  43.1  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1760  cobalt transport protein  21.82 
 
 		 291 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12800  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  24.74 
 
 		 256 aa  42.7  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>