103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_25720 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_25720  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  100 
 
 
241 aa  491  9.999999999999999e-139  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4773  cobalt transport protein  43.23 
 
 
239 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2319  cobalt transport protein  42.19 
 
 
245 aa  172  3.9999999999999995e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.945459 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2623  hypothetical protein  39.91 
 
 
246 aa  156  2e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2306  cobalt transport protein  39.25 
 
 
257 aa  144  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23150  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  38.39 
 
 
240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0420  cobalt ABC transporter permease  32.13 
 
 
233 aa  106  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0190437  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1768  cobalt transport protein  35.14 
 
 
232 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0283  transporter, putative  31.34 
 
 
234 aa  99.4  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1433  cobalt transport protein  31.8 
 
 
277 aa  93.6  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.43153  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0330  cobalt transport protein  35.19 
 
 
238 aa  89.7  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0314  cobalt transport protein  35.2 
 
 
250 aa  87.8  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.892766  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0242  hypothetical protein  28.26 
 
 
236 aa  85.9  5e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4171  cobalt transport protein  29.24 
 
 
249 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00476195  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4597  cobalt transport protein  28.33 
 
 
244 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0314465 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2654  cobalt transport protein  29.07 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.36556  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2157  ABC transporter, permease protein, putative  29.41 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000133808  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1483  cobalt transport protein  33.33 
 
 
225 aa  79.7  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0323  cobalt transport protein  31.31 
 
 
242 aa  74.3  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0905  hypothetical protein  30.83 
 
 
238 aa  72.4  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.313677  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1597  transporter, putative  33.87 
 
 
235 aa  70.5  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0899  ABC transporter, permease protein, putative  34.69 
 
 
238 aa  67  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  29.5 
 
 
267 aa  65.5  0.0000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00730  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  36.84 
 
 
250 aa  65.1  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.648464  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3551  cobalt ABC transporter, permease protein  25.93 
 
 
287 aa  63.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401892  normal  0.225242 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0678  cobalt transport protein  24.56 
 
 
227 aa  63.9  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  25 
 
 
266 aa  63.5  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  28.32 
 
 
266 aa  62  0.000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1493  cobalt transport protein  26.17 
 
 
231 aa  59.3  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.192292  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0712  cobalt transport protein  25.56 
 
 
243 aa  58.2  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  30.36 
 
 
266 aa  56.2  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0335  cobalt transport protein  25.96 
 
 
253 aa  54.7  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0256  hypothetical protein  28.28 
 
 
232 aa  53.9  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  25.32 
 
 
264 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3088  cobalt transport protein  27 
 
 
226 aa  53.9  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1990  putative cobalt transport protein  25.34 
 
 
279 aa  53.1  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  25.32 
 
 
264 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1302  cobalt transport protein  29.53 
 
 
267 aa  52.8  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0789486  normal  0.0436887 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3823  cobalt transport protein  29.46 
 
 
266 aa  53.1  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457934  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  25.32 
 
 
264 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  25.32 
 
 
264 aa  52.4  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  25.32 
 
 
264 aa  52.4  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  25.32 
 
 
264 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  25.32 
 
 
264 aa  52.4  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  25.32 
 
 
264 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07620  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  22.54 
 
 
276 aa  52  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0310  hypothetical protein  25.44 
 
 
241 aa  52  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0573771  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  31.37 
 
 
264 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0380  cobalt transport protein  28 
 
 
254 aa  51.2  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.709452  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  25.32 
 
 
264 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3887  cobalt transport protein  25.16 
 
 
270 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000020913  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2822  cobalt transport protein  28.46 
 
 
261 aa  50.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2704  cobalt transport protein  24.22 
 
 
285 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  30.39 
 
 
264 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  28.04 
 
 
265 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1788  cobalt transport protein  21.46 
 
 
291 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.121417  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1760  cobalt transport protein  21.46 
 
 
291 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0247  cobalt transport protein  25.75 
 
 
269 aa  48.9  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.224698  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  29.63 
 
 
265 aa  48.9  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0828  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  27.03 
 
 
255 aa  48.9  0.00008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.404494  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  21.43 
 
 
267 aa  48.1  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1604  ABC transporter, permease protein, putative  24.3 
 
 
228 aa  47.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  29.66 
 
 
332 aa  47.4  0.0002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0598  cobalt transport protein  30.91 
 
 
261 aa  47.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157547  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0077  cobalt transport protein  31.43 
 
 
246 aa  47.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.67532  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  34.04 
 
 
810 aa  47.8  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  23.68 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  26.32 
 
 
264 aa  47  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  28.7 
 
 
259 aa  46.6  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0226  cobalt transport protein  29.06 
 
 
262 aa  47  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  23.2 
 
 
265 aa  46.2  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1922  cobalt transport protein  29.63 
 
 
221 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.493439  hitchhiker  0.00315513 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  22.83 
 
 
267 aa  45.4  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07520  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  27.4 
 
 
270 aa  45.8  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.508014 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0666  cobalt ABC transporter, permease protein  30.1 
 
 
336 aa  44.7  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0320  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  31.91 
 
 
267 aa  44.7  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00398229  hitchhiker  1.85295e-17 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf374  cobalt ABC transporter, permease protein  27.88 
 
 
314 aa  44.7  0.001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004205  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  25.31 
 
 
269 aa  45.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  29.59 
 
 
264 aa  44.3  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0027  hypothetical protein  33.94 
 
 
255 aa  43.9  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1879  cobalt transport protein  24.19 
 
 
252 aa  43.9  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.200735  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2044  cobalt transport protein  31.71 
 
 
264 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25955  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1243  cobalt transport protein  29.73 
 
 
301 aa  44.3  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  27.14 
 
 
263 aa  44.3  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  27.14 
 
 
263 aa  44.3  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  24.02 
 
 
310 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  24.51 
 
 
264 aa  43.1  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  27.12 
 
 
268 aa  43.5  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  27.12 
 
 
268 aa  43.5  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0318  cobalt transport protein  25.89 
 
 
262 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000082775  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1413  cobalt transport protein  26.5 
 
 
260 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  25 
 
 
268 aa  43.1  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0337  cobalt transport protein  21.68 
 
 
256 aa  43.1  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1545  cobalt transport protein  29.69 
 
 
276 aa  42.7  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.679113  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3444  cobalt transport protein  26.72 
 
 
265 aa  42.7  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0362391 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2688  cobalt transport protein  27.2 
 
 
321 aa  42.4  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  24.6 
 
 
268 aa  42.7  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  24.6 
 
 
268 aa  42.4  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  25 
 
 
268 aa  42.4  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5234  cobalt transport protein  24.11 
 
 
283 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>