54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1604 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1604  ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 		 228 aa  451  1.0000000000000001e-126  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1493  cobalt transport protein  44.81 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.192292  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1597  transporter, putative  30.14 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0242  hypothetical protein  33.9 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2654  cobalt transport protein  24.44 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.36556  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0283  transporter, putative  26.92 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0335  cobalt transport protein  25.87 
 
 		 253 aa  72  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1433  cobalt transport protein  30.34 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.43153  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0905  hypothetical protein  30.26 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.313677  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1768  cobalt transport protein  30.82 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4597  cobalt transport protein  31.25 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0314465 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1483  cobalt transport protein  28.8 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2157  ABC transporter, permease protein, putative  26.89 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000133808  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0256  hypothetical protein  31.58 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0314  cobalt transport protein  30.39 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.892766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4171  cobalt transport protein  29.85 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00476195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0310  hypothetical protein  32.26 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0573771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0420  cobalt ABC transporter permease  29.36 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0190437  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3088  cobalt transport protein  28.8 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2319  cobalt transport protein  30.08 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.945459 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0330  cobalt transport protein  23.46 
 
 		 238 aa  57  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0678  cobalt transport protein  25.35 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1800  cobalt transport protein  28.77 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0899  ABC transporter, permease protein, putative  27.68 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2623  hypothetical protein  26.67 
 
 		 246 aa  54.3  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  31.08 
 
 		 268 aa  53.5  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  31.08 
 
 		 268 aa  53.5  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0260  hypothetical protein  25.68 
 
 		 266 aa  53.1  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.79252  normal  0.480643 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4773  cobalt transport protein  25 
 
 		 239 aa  52.8  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00730  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  29.75 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.648464  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  30.87 
 
 		 268 aa  52  0.000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0369  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  25.11 
 
 		 273 aa  50.4  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3101  cobalt transport protein  28.3 
 
 		 233 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.486493  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0380  cobalt transport protein  23.62 
 
 		 254 aa  45.4  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.709452  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0007  cobalt transport protein  25.83 
 
 		 258 aa  45.4  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0712  cobalt transport protein  25.86 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  24.56 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1990  putative cobalt transport protein  23.35 
 
 		 279 aa  43.9  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024453  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4125  cobalt transport protein  27.63 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.902173  hitchhiker  0.0000589617 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0323  cobalt transport protein  21.24 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1645  cobalt transport protein  26.58 
 
 		 247 aa  43.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020196 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05107  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ  22.06 
 
 		 279 aa  43.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0172  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  25.76 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  19.53 
 
 		 273 aa  42.7  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1834  putative cobalt ABC transporter, permease protein  19.53 
 
 		 273 aa  42.7  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3887  cobalt transport protein  25.47 
 
 		 270 aa  42.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000020913  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  24.46 
 
 		 267 aa  43.1  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1539  cobalt transport protein  30 
 
 		 245 aa  42.4  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001241  transmembrane component MtsC of energizing module of methionine-regulated ECF transporter  21.21 
 
 		 279 aa  42.7  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529253  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25720  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  24.3 
 
 		 241 aa  42.4  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2306  cobalt transport protein  26.85 
 
 		 257 aa  42.4  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23150  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  22.4 
 
 		 240 aa  42  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  26.92 
 
 		 267 aa  42  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  23.81 
 
 		 266 aa  41.6  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>