44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0335 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0335  cobalt transport protein  100 
 
 
253 aa  500  1e-141  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0256  hypothetical protein  39.02 
 
 
232 aa  103  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2654  cobalt transport protein  34.72 
 
 
231 aa  93.6  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.36556  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1433  cobalt transport protein  43.88 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.43153  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2157  ABC transporter, permease protein, putative  30.5 
 
 
237 aa  83.2  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000133808  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3088  cobalt transport protein  31.16 
 
 
226 aa  81.6  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0905  hypothetical protein  31.2 
 
 
238 aa  77.8  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.313677  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0283  transporter, putative  30.81 
 
 
234 aa  77.8  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0314  cobalt transport protein  31.58 
 
 
250 aa  75.5  0.0000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.892766  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0242  hypothetical protein  28.83 
 
 
236 aa  73.6  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1493  cobalt transport protein  34.95 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.192292  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1604  ABC transporter, permease protein, putative  25.87 
 
 
228 aa  72  0.000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0323  cobalt transport protein  31.28 
 
 
242 aa  71.6  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1483  cobalt transport protein  39.39 
 
 
225 aa  71.6  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0330  cobalt transport protein  29.45 
 
 
238 aa  68.2  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4773  cobalt transport protein  29.27 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4597  cobalt transport protein  33.79 
 
 
244 aa  65.9  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0314465 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2306  cobalt transport protein  31.03 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1597  transporter, putative  33.65 
 
 
235 aa  64.3  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0380  cobalt transport protein  29.17 
 
 
254 aa  63.2  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.709452  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0899  ABC transporter, permease protein, putative  30.83 
 
 
238 aa  62.8  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23150  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  31.39 
 
 
240 aa  61.6  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4171  cobalt transport protein  41.57 
 
 
249 aa  60.1  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00476195  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0678  cobalt transport protein  25 
 
 
227 aa  58.5  0.00000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0420  cobalt ABC transporter permease  22.83 
 
 
233 aa  56.2  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0190437  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00730  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  30.93 
 
 
250 aa  56.6  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.648464  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2319  cobalt transport protein  26.04 
 
 
245 aa  55.5  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.945459 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2623  hypothetical protein  25.21 
 
 
246 aa  54.7  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1768  cobalt transport protein  28.89 
 
 
232 aa  52.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0310  hypothetical protein  28.12 
 
 
241 aa  51.6  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0573771  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3101  cobalt transport protein  36.46 
 
 
233 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.486493  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25720  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  25.96 
 
 
241 aa  50.4  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001241  transmembrane component MtsC of energizing module of methionine-regulated ECF transporter  25 
 
 
279 aa  48.5  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529253  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05107  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ  23.31 
 
 
279 aa  47  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1990  putative cobalt transport protein  23.85 
 
 
279 aa  46.2  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024453  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1229  cobalt transport protein  27.82 
 
 
322 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.379694 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0348  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  27.27 
 
 
276 aa  45.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1632  cobalt transport family protein  26.15 
 
 
276 aa  44.7  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8786  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporter-like protein  29.6 
 
 
272 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0337  cobalt transport protein  26.61 
 
 
256 aa  42.7  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  21.05 
 
 
273 aa  42.7  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1332  cobalt transport protein  30 
 
 
241 aa  43.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256618  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1834  putative cobalt ABC transporter, permease protein  21.05 
 
 
273 aa  42.7  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2498  cobalt transport protein  24.19 
 
 
266 aa  42  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>