135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_00730 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_00730  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  100 
 
 
250 aa  498  1e-140  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.648464  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0420  cobalt ABC transporter permease  31.8 
 
 
233 aa  113  3e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0190437  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1433  cobalt transport protein  32.03 
 
 
277 aa  112  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.43153  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2654  cobalt transport protein  32.9 
 
 
231 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.36556  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0283  transporter, putative  32.56 
 
 
234 aa  105  7e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0330  cobalt transport protein  36.84 
 
 
238 aa  105  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0314  cobalt transport protein  31.56 
 
 
250 aa  103  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.892766  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1768  cobalt transport protein  30.87 
 
 
232 aa  102  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2623  hypothetical protein  30.3 
 
 
246 aa  100  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4773  cobalt transport protein  29.31 
 
 
239 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1597  transporter, putative  32.21 
 
 
235 aa  98.6  8e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2319  cobalt transport protein  33.03 
 
 
245 aa  95.1  8e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.945459 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2157  ABC transporter, permease protein, putative  30.17 
 
 
237 aa  89.7  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000133808  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0905  hypothetical protein  35.66 
 
 
238 aa  89.4  5e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.313677  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0899  ABC transporter, permease protein, putative  36.99 
 
 
238 aa  86.7  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2306  cobalt transport protein  29.41 
 
 
257 aa  85.5  8e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0242  hypothetical protein  25.47 
 
 
236 aa  81.6  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0256  hypothetical protein  28.12 
 
 
232 aa  79  0.00000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25720  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  36.84 
 
 
241 aa  78.2  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0335  cobalt transport protein  31.51 
 
 
253 aa  77.8  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1483  cobalt transport protein  30.14 
 
 
225 aa  76.6  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3088  cobalt transport protein  31 
 
 
226 aa  76.6  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4597  cobalt transport protein  28.1 
 
 
244 aa  75.1  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0314465 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0323  cobalt transport protein  29.25 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23150  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  34.71 
 
 
240 aa  74.3  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  35.94 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  35.16 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  35.94 
 
 
264 aa  72  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  35.94 
 
 
264 aa  72  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4171  cobalt transport protein  33.08 
 
 
249 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00476195  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  34.38 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  34.38 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  34.38 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  34.38 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  34.38 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  34.38 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  34.38 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1604  ABC transporter, permease protein, putative  29.75 
 
 
228 aa  69.7  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1834  putative cobalt ABC transporter, permease protein  28.99 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  28.26 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  31.54 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  31.35 
 
 
268 aa  68.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  31.35 
 
 
268 aa  68.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0678  cobalt transport protein  25.12 
 
 
227 aa  66.2  0.0000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0629  cobalt transport protein  32.56 
 
 
438 aa  65.9  0.0000000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.35082  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1972  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  28.67 
 
 
275 aa  63.9  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0348  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  29.85 
 
 
276 aa  63.9  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0666  cobalt ABC transporter, permease protein  36.54 
 
 
336 aa  63.5  0.000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  35.14 
 
 
265 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  29.57 
 
 
266 aa  63.9  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1879  cobalt transport protein  26.61 
 
 
252 aa  63.5  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.200735  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  30.08 
 
 
265 aa  63.2  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  26.77 
 
 
269 aa  61.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  30.94 
 
 
267 aa  61.2  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05107  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ  26.88 
 
 
279 aa  61.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0337  cobalt transport protein  34.91 
 
 
256 aa  60.8  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  28.86 
 
 
257 aa  60.5  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0310  hypothetical protein  27.52 
 
 
241 aa  60.1  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0573771  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1632  cobalt transport family protein  29.75 
 
 
276 aa  59.7  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0828  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  30.43 
 
 
255 aa  60.1  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.404494  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  31.5 
 
 
268 aa  59.7  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  32.23 
 
 
268 aa  59.3  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0682  cobalt transport protein  29.77 
 
 
248 aa  59.3  0.00000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000924748  normal  0.134467 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  32.23 
 
 
268 aa  58.9  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  35.92 
 
 
265 aa  58.9  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  31.01 
 
 
263 aa  57.8  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2386  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  27.95 
 
 
287 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00268022  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2498  cobalt transport protein  28.66 
 
 
266 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf374  cobalt ABC transporter, permease protein  32.38 
 
 
314 aa  58.2  0.0000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004205  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001241  transmembrane component MtsC of energizing module of methionine-regulated ECF transporter  25.17 
 
 
279 aa  58.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529253  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  31.01 
 
 
263 aa  57.8  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  30.26 
 
 
268 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1501  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  26.78 
 
 
293 aa  57.4  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  33.33 
 
 
267 aa  57.4  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  34.48 
 
 
332 aa  57  0.0000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3551  cobalt ABC transporter, permease protein  32.35 
 
 
287 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401892  normal  0.225242 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  27.43 
 
 
266 aa  57  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2425  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  25.71 
 
 
287 aa  56.6  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434651  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0380  cobalt transport protein  26.61 
 
 
254 aa  56.2  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.709452  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07620  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  29.66 
 
 
276 aa  56.2  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0226  cobalt transport protein  23.19 
 
 
262 aa  56.2  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1990  putative cobalt transport protein  28.47 
 
 
279 aa  56.2  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024453  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1493  cobalt transport protein  29.36 
 
 
231 aa  56.2  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.192292  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2659  cobalt transport protein  25.71 
 
 
266 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000035997 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0247  cobalt transport protein  29.13 
 
 
269 aa  55.8  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.224698  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2642  cobalt transport protein  24.03 
 
 
273 aa  55.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.357292  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  29.63 
 
 
264 aa  54.7  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2462  cobalt transport protein  24.03 
 
 
287 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  31.48 
 
 
266 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0369  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  26.25 
 
 
273 aa  54.7  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12800  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  27.57 
 
 
256 aa  55.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2707  cobalt transport protein  27.15 
 
 
277 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2764  cobalt transport protein  27.15 
 
 
277 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2822  cobalt transport protein  28.68 
 
 
261 aa  53.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  24.71 
 
 
259 aa  53.9  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  31.2 
 
 
264 aa  54.3  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  30.16 
 
 
270 aa  53.9  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1539  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  28.57 
 
 
278 aa  53.1  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.173972  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2485  cobalt transport protein  29.41 
 
 
256 aa  52.8  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.08544  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  28.85 
 
 
263 aa  52.4  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>