182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0614 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  100 
 
 		 257 aa  520  1e-147  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0682  cobalt transport protein  46.09 
 
 		 248 aa  205  6e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000924748  normal  0.134467 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12800  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  39.53 
 
 		 256 aa  168  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2485  cobalt transport protein  40.39 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.08544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  26.92 
 
 		 266 aa  94.7  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  29.82 
 
 		 269 aa  93.6  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  32.75 
 
 		 267 aa  90.5  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0027  hypothetical protein  27.59 
 
 		 255 aa  91.3  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  27.95 
 
 		 264 aa  90.1  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1879  cobalt transport protein  30.32 
 
 		 252 aa  89.4  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.200735  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0226  cobalt transport protein  28.51 
 
 		 262 aa  89  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  27.92 
 
 		 268 aa  88.6  8e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  28.81 
 
 		 266 aa  88.6  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  27.55 
 
 		 268 aa  87.8  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  28.46 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  28.46 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0318  cobalt transport protein  28.79 
 
 		 262 aa  85.9  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000082775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3444  cobalt transport protein  30.84 
 
 		 265 aa  85.9  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  26.24 
 
 		 310 aa  85.9  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  25.3 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3823  cobalt transport protein  34.44 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457934  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  26.94 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1608  cobalt transport protein  27.24 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  26.27 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  26.27 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  27.57 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0828  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  31.19 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.404494  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  26.82 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  27.27 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  26.82 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  26.82 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  26.82 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  26.82 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  26.82 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  27.78 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  26.82 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  26.36 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0247  cobalt transport protein  27.45 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.224698  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  26.36 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  25.1 
 
 		 267 aa  79  0.00000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  26.36 
 
 		 264 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  27.35 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2822  cobalt transport protein  28.57 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1539  cobalt transport protein  29.49 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  28.2 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  27.93 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0260  hypothetical protein  28.35 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.79252  normal  0.480643 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  24.23 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1947  cobalt ABC transporter permease protein  26.95 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.259406  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0589  ABC-type cobalt transport system  30.36 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0946935  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3864  cobalt transport protein  30.38 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1972  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  26.12 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0370  cobalt transport protein  27.65 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  25.91 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1693  cobalt transport protein  24.62 
 
 		 265 aa  72  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0637761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  31.5 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  25.11 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07620  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  25.19 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1257  cobalt transport protein  27.75 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000290738  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2044  cobalt transport protein  28.44 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25955  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  24.91 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  24.89 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  26.59 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1501  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  23.81 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0929  cobalt transport protein  26.39 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000291148  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0951  cobalt transport protein  25.93 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.222726  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0253  cobalt transport protein  30.49 
 
 		 313 aa  67  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.648323  normal  0.0540671 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0077  cobalt transport protein  26.46 
 
 		 246 aa  67  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.67532  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2111  cobalt transport protein  27.54 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.105406  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3551  cobalt ABC transporter, permease protein  29.23 
 
 		 287 aa  65.5  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401892  normal  0.225242 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1836  cobalt transport protein  37.04 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.507525  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  32.06 
 
 		 269 aa  65.1  0.0000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1535  cobalt transport protein  26.13 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.811853  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07520  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  25.79 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.508014 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1702  cobalt transport protein  23.79 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  28.7 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf374  cobalt ABC transporter, permease protein  32.04 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004205  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3887  cobalt transport protein  23.43 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000020913  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0369  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  25.11 
 
 		 273 aa  62  0.000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0337  cobalt transport protein  33.33 
 
 		 256 aa  62  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  30.21 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1800  cobalt transport protein  24.26 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1545  cobalt transport protein  30.6 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.679113  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1302  cobalt transport protein  25.1 
 
 		 267 aa  62  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0789486  normal  0.0436887 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  27.35 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0997  cobalt transport protein  26.27 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  normal  0.445886 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1950  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporters-like protein  26.71 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  23.25 
 
 		 810 aa  61.2  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3649  cobalt transport protein  28.76 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001241  transmembrane component MtsC of energizing module of methionine-regulated ECF transporter  31.58 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529253  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2115  cobalt transport protein  36.36 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.990281  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  24.79 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1539  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  32.74 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.173972  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3324  ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0414  cobalt transport protein  24.29 
 
 		 895 aa  59.3  0.00000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.624811 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4408  cobalt transport protein  23.53 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.371368  normal  0.0141186 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0583  cobalt transport family protein  25.21 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1632  cobalt transport family protein  25.93 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0629  cobalt transport protein  31.91 
 
 		 438 aa  58.9  0.00000008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.35082  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1834  putative cobalt ABC transporter, permease protein  26.5 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>