76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0256 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0256  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  458  9.999999999999999e-129  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0335  cobalt transport protein  39.02 
 
 
253 aa  103  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3088  cobalt transport protein  27.78 
 
 
226 aa  94  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2654  cobalt transport protein  29.28 
 
 
231 aa  88.6  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.36556  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1433  cobalt transport protein  33.08 
 
 
277 aa  82.4  0.000000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.43153  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0314  cobalt transport protein  35.54 
 
 
250 aa  75.1  0.0000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.892766  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0905  hypothetical protein  31.51 
 
 
238 aa  74.7  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.313677  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1483  cobalt transport protein  28.5 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2157  ABC transporter, permease protein, putative  31.37 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000133808  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1604  ABC transporter, permease protein, putative  31.5 
 
 
228 aa  68.9  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0420  cobalt ABC transporter permease  24.09 
 
 
233 aa  67.8  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0190437  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0283  transporter, putative  29.19 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0242  hypothetical protein  28.57 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0330  cobalt transport protein  25.75 
 
 
238 aa  63.2  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2623  hypothetical protein  27.46 
 
 
246 aa  62.8  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4773  cobalt transport protein  28.24 
 
 
239 aa  61.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23150  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  28.57 
 
 
240 aa  60.5  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0310  hypothetical protein  26.63 
 
 
241 aa  60.5  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0573771  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1597  transporter, putative  31.4 
 
 
235 aa  60.8  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00730  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  28.12 
 
 
250 aa  59.3  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.648464  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4597  cobalt transport protein  28.79 
 
 
244 aa  59.3  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0314465 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0899  ABC transporter, permease protein, putative  29.25 
 
 
238 aa  57.4  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0380  cobalt transport protein  25.37 
 
 
254 aa  56.2  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.709452  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2306  cobalt transport protein  28.93 
 
 
257 aa  55.8  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1972  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  24.63 
 
 
275 aa  55.5  0.0000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2319  cobalt transport protein  29.03 
 
 
245 aa  54.7  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.945459 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2498  cobalt transport protein  26.43 
 
 
266 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  24.05 
 
 
273 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1768  cobalt transport protein  27.36 
 
 
232 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1693  cobalt transport protein  26.19 
 
 
265 aa  53.9  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0637761  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1834  putative cobalt ABC transporter, permease protein  23.81 
 
 
273 aa  53.1  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0369  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  23.14 
 
 
273 aa  53.5  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1493  cobalt transport protein  25.23 
 
 
231 aa  52.8  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.192292  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0884  cobalt transport protein  34.56 
 
 
291 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1539  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  24.58 
 
 
278 aa  52.8  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.173972  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4171  cobalt transport protein  27.07 
 
 
249 aa  52  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00476195  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0323  cobalt transport protein  26.92 
 
 
242 aa  52  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2667  cobalt transport protein  24.81 
 
 
266 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0678  cobalt transport protein  24.63 
 
 
227 aa  51.6  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25720  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  28.28 
 
 
241 aa  50.1  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1990  putative cobalt transport protein  25.6 
 
 
279 aa  49.3  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024453  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2386  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  24.24 
 
 
287 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00268022  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  32.94 
 
 
268 aa  48.9  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  32.94 
 
 
268 aa  48.9  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2659  cobalt transport protein  23.66 
 
 
266 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000035997 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  26.61 
 
 
268 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05107  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ  25.98 
 
 
279 aa  48.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2425  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  23.66 
 
 
287 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434651  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0348  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  23.93 
 
 
276 aa  48.5  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001241  transmembrane component MtsC of energizing module of methionine-regulated ECF transporter  25.98 
 
 
279 aa  47.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529253  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2462  cobalt transport protein  23.66 
 
 
287 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2642  cobalt transport protein  23.66 
 
 
273 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.357292  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2657  cobalt transport protein  23.26 
 
 
266 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.287835  hitchhiker  0.000000289223 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2710  cobalt transport protein  23.66 
 
 
266 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3139  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.26 
 
 
255 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.122579  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1539  cobalt transport protein  27.18 
 
 
245 aa  43.9  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0712  cobalt transport protein  26.72 
 
 
243 aa  43.9  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0027  hypothetical protein  24.62 
 
 
255 aa  43.9  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2634  cobalt transport protein  32.26 
 
 
315 aa  43.5  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3101  cobalt transport protein  29.2 
 
 
233 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.486493  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2669  cobalt transport protein  22.9 
 
 
266 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00761496  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3229  cobalt transport protein  25 
 
 
290 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.500857 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2867  cobalt transport protein  25 
 
 
290 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  29.52 
 
 
267 aa  42.7  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  25.71 
 
 
264 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1302  cobalt transport protein  24.56 
 
 
267 aa  42.4  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0789486  normal  0.0436887 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  25.71 
 
 
264 aa  42.4  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  25.71 
 
 
264 aa  42.4  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  25.71 
 
 
264 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  25.71 
 
 
264 aa  42.4  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  25.71 
 
 
264 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  25.71 
 
 
264 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3551  cobalt ABC transporter, permease protein  25.78 
 
 
287 aa  42  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401892  normal  0.225242 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1545  cobalt transport protein  22.31 
 
 
276 aa  42  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.679113  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0247  cobalt transport protein  26.09 
 
 
269 aa  42  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.224698  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  24.37 
 
 
264 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>