104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3101 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3101  cobalt transport protein  100 
 
 		 233 aa  442  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.486493  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0337  cobalt transport protein  34.21 
 
 		 256 aa  61.6  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0318  cobalt transport protein  31.29 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000082775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5234  cobalt transport protein  29.93 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  28.8 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  29.85 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0348  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  33.33 
 
 		 276 aa  55.1  0.0000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2498  cobalt transport protein  26.32 
 
 		 266 aa  55.1  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  31.15 
 
 		 259 aa  53.9  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1950  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporters-like protein  30.69 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2704  cobalt transport protein  28.26 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  34.06 
 
 		 264 aa  53.1  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0712  cobalt transport protein  32.09 
 
 		 243 aa  53.5  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1483  cobalt transport protein  33.6 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0666  cobalt ABC transporter, permease protein  31.93 
 
 		 336 aa  52.8  0.000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0260  hypothetical protein  30.95 
 
 		 266 aa  52.8  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.79252  normal  0.480643 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2634  cobalt transport protein  37.76 
 
 		 315 aa  51.6  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  33.33 
 
 		 268 aa  51.6  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1632  cobalt transport family protein  29.66 
 
 		 276 aa  51.6  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3139  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  39.36 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.122579  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0929  cobalt transport protein  35.58 
 
 		 271 aa  51.2  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000291148  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0609  cobalt transport protein  29.79 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  29.91 
 
 		 269 aa  51.2  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  25.81 
 
 		 266 aa  50.8  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1545  cobalt transport protein  32.77 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.679113  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1788  cobalt transport protein  26.67 
 
 		 291 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.121417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0335  cobalt transport protein  36.46 
 
 		 253 aa  50.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1961  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  35.48 
 
 		 261 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1760  cobalt transport protein  26.67 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  30.72 
 
 		 263 aa  50.1  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  30.72 
 
 		 263 aa  50.1  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2654  cobalt transport protein  28.86 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.36556  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  29.63 
 
 		 264 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  29.63 
 
 		 264 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  29.63 
 
 		 264 aa  49.7  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  29.63 
 
 		 264 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  29.63 
 
 		 264 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0369  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  28.81 
 
 		 273 aa  49.7  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  31.91 
 
 		 264 aa  49.7  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  29.63 
 
 		 264 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  29.63 
 
 		 264 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3434  hypothetical protein  38.95 
 
 		 258 aa  49.3  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.971737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0951  cobalt transport protein  35.56 
 
 		 271 aa  49.3  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.222726  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  29.63 
 
 		 264 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  29.63 
 
 		 264 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1800  cobalt transport protein  29.93 
 
 		 279 aa  49.3  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  30.85 
 
 		 264 aa  49.3  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1604  ABC transporter, permease protein, putative  28.3 
 
 		 228 aa  48.9  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3551  cobalt ABC transporter, permease protein  30.84 
 
 		 287 aa  48.9  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401892  normal  0.225242 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  28.85 
 
 		 264 aa  48.9  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3451  cobalt transport protein  34.31 
 
 		 261 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1834  putative cobalt ABC transporter, permease protein  24.83 
 
 		 273 aa  48.5  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  25.36 
 
 		 273 aa  48.5  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1535  cobalt transport protein  34.96 
 
 		 263 aa  48.5  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.811853  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  29.21 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4408  cobalt transport protein  34.31 
 
 		 260 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.371368  normal  0.0141186 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  25.11 
 
 		 265 aa  48.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0629  cobalt transport protein  32.08 
 
 		 438 aa  48.1  0.0001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.35082  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  26.19 
 
 		 310 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3473  cobalt transport protein  27.62 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  30.89 
 
 		 268 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  30.89 
 
 		 268 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05107  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ  24.64 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  29.14 
 
 		 268 aa  45.8  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0247  cobalt transport protein  30.38 
 
 		 269 aa  46.2  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.224698  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001241  transmembrane component MtsC of energizing module of methionine-regulated ECF transporter  26.24 
 
 		 279 aa  45.8  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529253  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0583  cobalt transport family protein  33.68 
 
 		 257 aa  45.8  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2095  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporter-like protein  30.49 
 
 		 255 aa  45.4  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0329891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  27.78 
 
 		 270 aa  45.4  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1990  putative cobalt transport protein  25.98 
 
 		 279 aa  45.4  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024453  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0323  cobalt transport protein  29.19 
 
 		 242 aa  45.4  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1597  transporter, putative  26.42 
 
 		 235 aa  45.4  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  28.21 
 
 		 263 aa  45.4  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  35.8 
 
 		 265 aa  45.1  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0506  cobalt transport protein  38.64 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  27.78 
 
 		 264 aa  43.9  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1332  cobalt transport protein  34.67 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256618  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0226  cobalt transport protein  26.4 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  31.85 
 
 		 266 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  25.44 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  25.44 
 
 		 268 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1947  cobalt ABC transporter permease protein  30.16 
 
 		 259 aa  43.9  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.259406  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0828  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  32.22 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.404494  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0256  hypothetical protein  29.2 
 
 		 232 aa  43.5  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2440  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  29.45 
 
 		 270 aa  43.5  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1894  cobalt transport protein  33.7 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.154103  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3805  cobalt transport protein  29.69 
 
 		 282 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.829315  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0380  cobalt transport protein  33.33 
 
 		 254 aa  43.5  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.709452  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1879  cobalt transport protein  29.52 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.200735  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  32.71 
 
 		 264 aa  43.5  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2306  cobalt transport protein  30.21 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1413  cobalt transport protein  29.08 
 
 		 260 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0242  hypothetical protein  25.96 
 
 		 236 aa  43.1  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0766  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  24.77 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.156344  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4597  cobalt transport protein  37.65 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0314465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8786  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporter-like protein  27.4 
 
 		 272 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1539  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  24.43 
 
 		 278 aa  42.7  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.173972  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1972  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  25.83 
 
 		 275 aa  42.7  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  34.83 
 
 		 770 aa  42.7  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  32.94 
 
 		 265 aa  42.7  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>