69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0506 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0506  cobalt transport protein  100 
 
 		 204 aa  387  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2312  putative cobalt transport system permease protein  57.29 
 
 		 198 aa  202  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4656  cobalt transport protein  48.77 
 
 		 200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.365501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3660  cobalt transport protein  40.51 
 
 		 196 aa  117  9e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1194  putative biotin ABC transporter, permease protein  29.85 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3687  cobalt transport protein  42.27 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.600557  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1730  cobalt transport protein  38.35 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1853  cobalt transport protein  38.81 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00024219 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3226  cobalt transport protein  39 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01760  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  35.96 
 
 		 209 aa  101  6e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.975631 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3462  cobalt transport protein  39.71 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2111  cobalt transport protein  35.57 
 
 		 216 aa  99  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0552533  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5368  cobalt transport protein  41.79 
 
 		 200 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.539179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5658  cobalt transport protein  41.79 
 
 		 200 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5279  cobalt transport protein  41.79 
 
 		 200 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1679  cobalt transport protein  39.2 
 
 		 216 aa  97.4  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5458  cobalt transport protein  41.33 
 
 		 201 aa  94.7  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00259272  normal  0.0904003 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1006  ABC transporter membrane spanning protein  34.31 
 
 		 206 aa  94.7  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2004  cobalt transport protein  37 
 
 		 214 aa  94.4  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.288516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0582  cobalt transport protein  40.4 
 
 		 202 aa  92.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21860  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  40.39 
 
 		 227 aa  92.8  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0623  cobalt transport protein  37.37 
 
 		 202 aa  88.2  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303566  normal  0.0342119 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3351  cobalt transport protein  36.59 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1527  cobalt transport protein  41.06 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2319  hypothetical protein  37.25 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3687  cobalt transport protein  32.32 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2174  ABC transporter inner membrane protein  35.75 
 
 		 196 aa  72  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0846  cobalt transport protein  37.4 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1157  cobalt transport protein  33.5 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.930884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3075  cobalt transport protein  34.01 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1332  cobalt transport protein  37.44 
 
 		 241 aa  64.7  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256618  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1751  cobalt transport protein  29.49 
 
 		 272 aa  61.6  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253796  normal  0.0321598 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20540  Cobalt transport protein  33.79 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5032  cobalt transport protein  33.05 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.298232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3288  cobalt transport protein  30.81 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.972587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1067  cobalt transport protein  30.2 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0502  cobalt transport protein  33.84 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4600  cobalt transport protein  30.61 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.610496  normal  0.640124 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4129  cobalt transport protein  32.16 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.373392  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  31.39 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  25.33 
 
 		 264 aa  52.8  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  22.32 
 
 		 268 aa  52.8  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  22.32 
 
 		 268 aa  52.8  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2320  cobalt transport protein  34.86 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.593749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1539  cobalt transport protein  35.78 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  22.03 
 
 		 267 aa  49.3  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3805  cobalt transport protein  30.91 
 
 		 282 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.829315  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0158  cobalt transport protein  31.88 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  22.91 
 
 		 268 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3101  cobalt transport protein  38.64 
 
 		 233 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.486493  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  22.47 
 
 		 268 aa  45.8  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  25.64 
 
 		 770 aa  44.7  0.0008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2913  cobalt transport protein  45.67 
 
 		 218 aa  45.1  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.505117 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  30.88 
 
 		 266 aa  44.7  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  21.24 
 
 		 267 aa  44.7  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  21.27 
 
 		 269 aa  44.3  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  24.73 
 
 		 269 aa  44.3  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0369  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  26.67 
 
 		 273 aa  44.3  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0583  cobalt transport family protein  27.31 
 
 		 257 aa  43.5  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3887  cobalt transport protein  21.89 
 
 		 270 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000020913  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0318  cobalt transport protein  24.89 
 
 		 262 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000082775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  20.26 
 
 		 267 aa  43.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  24.45 
 
 		 266 aa  43.1  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  22.17 
 
 		 267 aa  42.4  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3493  cobalt transport protein  30.22 
 
 		 280 aa  41.2  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.229995  normal  0.210593 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3441  cobalt transport protein  30.22 
 
 		 280 aa  41.2  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.389848 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3430  cobalt transport protein  30.22 
 
 		 280 aa  41.2  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0828  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  21.88 
 
 		 255 aa  41.6  0.009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.404494  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  24.67 
 
 		 264 aa  41.2  0.01  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>