83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2111 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2111  cobalt transport protein  100 
 
 
216 aa  423  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0552533  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1853  cobalt transport protein  71.56 
 
 
212 aa  306  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00024219 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1679  cobalt transport protein  42.78 
 
 
216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3351  cobalt transport protein  39.18 
 
 
204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21860  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  40.95 
 
 
227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172242  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2312  putative cobalt transport system permease protein  34.2 
 
 
198 aa  93.6  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0506  cobalt transport protein  39.57 
 
 
204 aa  92  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3660  cobalt transport protein  33.67 
 
 
196 aa  86.7  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3687  cobalt transport protein  34.91 
 
 
210 aa  85.1  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.600557  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2004  cobalt transport protein  30.2 
 
 
214 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.288516  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1194  putative biotin ABC transporter, permease protein  23.92 
 
 
217 aa  79  0.00000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1006  ABC transporter membrane spanning protein  30.05 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1067  cobalt transport protein  30.9 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1730  cobalt transport protein  33.67 
 
 
200 aa  76.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3687  cobalt transport protein  29.69 
 
 
197 aa  74.7  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4656  cobalt transport protein  35.21 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.365501  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1332  cobalt transport protein  33.17 
 
 
241 aa  71.6  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5458  cobalt transport protein  33.51 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00259272  normal  0.0904003 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0623  cobalt transport protein  29.8 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303566  normal  0.0342119 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  26.22 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3288  cobalt transport protein  26.51 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.972587  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  25.78 
 
 
268 aa  65.5  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2319  hypothetical protein  30.41 
 
 
155 aa  63.2  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3462  cobalt transport protein  29.76 
 
 
200 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5279  cobalt transport protein  33.5 
 
 
200 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5658  cobalt transport protein  33.5 
 
 
200 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5368  cobalt transport protein  33.5 
 
 
200 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.539179  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01760  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  31.53 
 
 
209 aa  62  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.975631 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1157  cobalt transport protein  29.52 
 
 
223 aa  60.8  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.930884  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3226  cobalt transport protein  29.35 
 
 
200 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  28.35 
 
 
269 aa  59.7  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  22.83 
 
 
267 aa  59.7  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  24.2 
 
 
267 aa  58.5  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1527  cobalt transport protein  35.68 
 
 
208 aa  58.2  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0846  cobalt transport protein  28.24 
 
 
198 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3075  cobalt transport protein  35.96 
 
 
198 aa  56.6  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  22.94 
 
 
269 aa  56.6  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2174  ABC transporter inner membrane protein  26.72 
 
 
196 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  25 
 
 
263 aa  53.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  25 
 
 
263 aa  53.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0828  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  25.93 
 
 
255 aa  53.1  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.404494  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0077  cobalt transport protein  23.56 
 
 
246 aa  53.1  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.67532  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0582  cobalt transport protein  28.08 
 
 
202 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45764  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2913  cobalt transport protein  44.44 
 
 
218 aa  52.8  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.505117 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  25.81 
 
 
264 aa  51.6  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  24.31 
 
 
264 aa  50.4  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  22.52 
 
 
266 aa  50.1  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5032  cobalt transport protein  28.57 
 
 
205 aa  49.3  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.298232  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0226  cobalt transport protein  25.35 
 
 
262 aa  49.3  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3887  cobalt transport protein  21.83 
 
 
270 aa  48.1  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000020913  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20540  Cobalt transport protein  28.91 
 
 
211 aa  48.1  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  22.48 
 
 
268 aa  47.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4600  cobalt transport protein  28.5 
 
 
197 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.610496  normal  0.640124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1751  cobalt transport protein  28.39 
 
 
272 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253796  normal  0.0321598 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  27.04 
 
 
265 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  23.64 
 
 
264 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  23.74 
 
 
264 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0260  hypothetical protein  30.34 
 
 
266 aa  44.7  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.79252  normal  0.480643 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  23.64 
 
 
264 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  23.74 
 
 
264 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  23.74 
 
 
264 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  23.74 
 
 
264 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  23.74 
 
 
264 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  23.74 
 
 
264 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  23.74 
 
 
264 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  22.48 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  21.33 
 
 
266 aa  43.9  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1539  cobalt transport protein  28.36 
 
 
197 aa  43.5  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  22.83 
 
 
810 aa  43.9  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  23.74 
 
 
264 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  21.33 
 
 
267 aa  43.9  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2799  cobalt transport protein  24.03 
 
 
284 aa  43.1  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161091  hitchhiker  0.0000401783 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0629  cobalt transport protein  25.62 
 
 
438 aa  43.1  0.003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.35082  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  22.12 
 
 
257 aa  43.1  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  23.74 
 
 
265 aa  42.7  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2320  cobalt transport protein  27.21 
 
 
197 aa  42.7  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.593749  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  23.74 
 
 
264 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  20.99 
 
 
262 aa  42.7  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  24.54 
 
 
268 aa  42  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4129  cobalt transport protein  34.34 
 
 
191 aa  42  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.373392  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  23.11 
 
 
265 aa  42  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1947  cobalt ABC transporter permease protein  21.98 
 
 
259 aa  41.6  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.259406  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  27.22 
 
 
266 aa  41.6  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>