68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2174 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2174  ABC transporter inner membrane protein  100 
 
 		 196 aa  363  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0846  cobalt transport protein  94.95 
 
 		 198 aa  298  4e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2319  hypothetical protein  82.35 
 
 		 155 aa  242  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5032  cobalt transport protein  55.84 
 
 		 205 aa  165  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.298232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2004  cobalt transport protein  42.16 
 
 		 214 aa  118  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.288516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3687  cobalt transport protein  40.41 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.600557  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4600  cobalt transport protein  36.04 
 
 		 197 aa  85.1  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.610496  normal  0.640124 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1006  ABC transporter membrane spanning protein  35.48 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1194  putative biotin ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3660  cobalt transport protein  33.67 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1679  cobalt transport protein  40.6 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3226  cobalt transport protein  37.57 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2312  putative cobalt transport system permease protein  36.56 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1539  cobalt transport protein  38.21 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2320  cobalt transport protein  37.4 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.593749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1730  cobalt transport protein  40 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1332  cobalt transport protein  41.4 
 
 		 241 aa  72  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256618  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5279  cobalt transport protein  39.2 
 
 		 200 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5658  cobalt transport protein  39.2 
 
 		 200 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5368  cobalt transport protein  39.2 
 
 		 200 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.539179  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0506  cobalt transport protein  36.64 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1853  cobalt transport protein  29.9 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00024219 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3462  cobalt transport protein  39.57 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1527  cobalt transport protein  37.56 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4656  cobalt transport protein  34.59 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.365501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5458  cobalt transport protein  44.04 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00259272  normal  0.0904003 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3075  cobalt transport protein  33.5 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0623  cobalt transport protein  32.99 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303566  normal  0.0342119 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1067  cobalt transport protein  30.77 
 
 		 255 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20540  Cobalt transport protein  33.65 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  24.09 
 
 		 267 aa  55.1  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  27.41 
 
 		 268 aa  54.7  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  27.41 
 
 		 268 aa  54.7  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2111  cobalt transport protein  28.89 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0552533  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3288  cobalt transport protein  30.08 
 
 		 249 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.972587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  40.2 
 
 		 264 aa  52.4  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  28.86 
 
 		 263 aa  52.8  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  28.86 
 
 		 263 aa  52.8  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  24.16 
 
 		 268 aa  50.8  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3887  cobalt transport protein  26.43 
 
 		 270 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000020913  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21860  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  31.96 
 
 		 227 aa  49.7  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0077  cobalt transport protein  25.12 
 
 		 246 aa  48.9  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.67532  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1702  cobalt transport protein  30.65 
 
 		 265 aa  48.9  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  27.19 
 
 		 268 aa  49.3  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3351  cobalt transport protein  30.65 
 
 		 204 aa  48.1  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1157  cobalt transport protein  30.46 
 
 		 223 aa  47.4  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.930884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  23.68 
 
 		 268 aa  47.4  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  23.68 
 
 		 268 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0318  cobalt transport protein  25.64 
 
 		 262 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000082775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1229  cobalt transport protein  32.69 
 
 		 322 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.379694 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2470  cobalt transport protein  25.66 
 
 		 275 aa  45.8  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105266  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0502  cobalt transport protein  36.93 
 
 		 201 aa  45.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  25.42 
 
 		 264 aa  45.4  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3687  cobalt transport protein  28.42 
 
 		 197 aa  45.1  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01760  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  33.67 
 
 		 209 aa  45.1  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.975631 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  32.03 
 
 		 263 aa  44.3  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1964  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit  26.11 
 
 		 255 aa  44.3  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1545  cobalt transport protein  29.47 
 
 		 276 aa  43.9  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.679113  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2867  cobalt transport protein  26.45 
 
 		 290 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  28.57 
 
 		 310 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3229  cobalt transport protein  26.45 
 
 		 290 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.500857 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0247  cobalt transport protein  31.52 
 
 		 269 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.224698  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  28.7 
 
 		 266 aa  42.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2175  cobalt transport protein  38.2 
 
 		 374 aa  42.4  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.706888 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  23.48 
 
 		 269 aa  42.4  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  22.83 
 
 		 332 aa  41.6  0.007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  24.56 
 
 		 267 aa  41.6  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  21.05 
 
 		 267 aa  41.2  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>