45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4600 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4600  cobalt transport protein  100 
 
 		 197 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.610496  normal  0.640124 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2320  cobalt transport protein  69.39 
 
 		 197 aa  239  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.593749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1539  cobalt transport protein  68.88 
 
 		 197 aa  236  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2004  cobalt transport protein  34.38 
 
 		 214 aa  88.2  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.288516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0846  cobalt transport protein  37.9 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2174  ABC transporter inner membrane protein  36.04 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1006  ABC transporter membrane spanning protein  30.26 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3687  cobalt transport protein  32.84 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.600557  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2319  hypothetical protein  33.87 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5032  cobalt transport protein  31.47 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.298232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3226  cobalt transport protein  30.46 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1527  cobalt transport protein  36.55 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0623  cobalt transport protein  31.02 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303566  normal  0.0342119 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0502  cobalt transport protein  33.88 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2312  putative cobalt transport system permease protein  31.79 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1679  cobalt transport protein  32.58 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1067  cobalt transport protein  31.46 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0582  cobalt transport protein  31.55 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3660  cobalt transport protein  29.29 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1730  cobalt transport protein  30.3 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21860  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  29.32 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  22.17 
 
 		 268 aa  52.8  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  22.17 
 
 		 268 aa  52.4  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3743  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.27 
 
 		 722 aa  50.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.265049 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  34.21 
 
 		 264 aa  50.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3462  cobalt transport protein  30.1 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1332  cobalt transport protein  29.1 
 
 		 241 aa  49.7  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256618  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3288  cobalt transport protein  29.51 
 
 		 249 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.972587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1853  cobalt transport protein  29.15 
 
 		 212 aa  48.1  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00024219 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0506  cobalt transport protein  30.41 
 
 		 204 aa  47.8  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2111  cobalt transport protein  29.85 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0552533  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  22.58 
 
 		 268 aa  46.2  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  22.58 
 
 		 268 aa  46.2  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0318  cobalt transport protein  23.33 
 
 		 262 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000082775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  26.55 
 
 		 268 aa  45.8  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4656  cobalt transport protein  31.11 
 
 		 200 aa  45.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.365501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1194  putative biotin ABC transporter, permease protein  21.21 
 
 		 217 aa  45.1  0.0006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3351  cobalt transport protein  26.52 
 
 		 204 aa  45.1  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5658  cobalt transport protein  31.52 
 
 		 200 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5368  cobalt transport protein  31.52 
 
 		 200 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.539179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5279  cobalt transport protein  31.52 
 
 		 200 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01760  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  28.8 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.975631 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  23.43 
 
 		 267 aa  43.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  24.03 
 
 		 269 aa  41.2  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  25.4 
 
 		 264 aa  41.2  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>