119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4656 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4656  cobalt transport protein  100 
 
 
200 aa  377  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.365501  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1730  cobalt transport protein  51.5 
 
 
200 aa  148  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5279  cobalt transport protein  51.24 
 
 
200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5368  cobalt transport protein  51.24 
 
 
200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.539179  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3226  cobalt transport protein  45.5 
 
 
200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5658  cobalt transport protein  51.24 
 
 
200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2312  putative cobalt transport system permease protein  45.32 
 
 
198 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3462  cobalt transport protein  46 
 
 
200 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0506  cobalt transport protein  48.77 
 
 
204 aa  127  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3075  cobalt transport protein  41.62 
 
 
198 aa  122  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01760  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  41.5 
 
 
209 aa  118  6e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.975631 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5458  cobalt transport protein  44.95 
 
 
201 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00259272  normal  0.0904003 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1194  putative biotin ABC transporter, permease protein  30.96 
 
 
217 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3687  cobalt transport protein  39.8 
 
 
210 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.600557  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3660  cobalt transport protein  36 
 
 
196 aa  106  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3351  cobalt transport protein  37.88 
 
 
204 aa  104  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21860  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  39.09 
 
 
227 aa  95.1  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172242  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1679  cobalt transport protein  37.75 
 
 
216 aa  92  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1853  cobalt transport protein  33.85 
 
 
212 aa  90.5  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00024219 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1527  cobalt transport protein  43.14 
 
 
208 aa  90.5  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  25.11 
 
 
267 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1006  ABC transporter membrane spanning protein  33.67 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3687  cobalt transport protein  34.01 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  26.24 
 
 
267 aa  82.4  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  30.91 
 
 
264 aa  81.6  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  29.46 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2111  cobalt transport protein  33.17 
 
 
216 aa  79.3  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0552533  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  33.04 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  32.74 
 
 
266 aa  79  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2319  hypothetical protein  37.42 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  30 
 
 
267 aa  77.4  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2004  cobalt transport protein  35.35 
 
 
214 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.288516  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  25.91 
 
 
270 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  24.55 
 
 
264 aa  75.5  0.0000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  28.7 
 
 
266 aa  74.7  0.0000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1067  cobalt transport protein  37.11 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2174  ABC transporter inner membrane protein  37.44 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1332  cobalt transport protein  38.1 
 
 
241 aa  73.2  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256618  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3288  cobalt transport protein  33.51 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.972587  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  26.67 
 
 
264 aa  72  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  26.67 
 
 
264 aa  72  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  26.67 
 
 
264 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  26.67 
 
 
264 aa  72  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  26.67 
 
 
264 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  26.67 
 
 
264 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  26.67 
 
 
264 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  26.67 
 
 
264 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  28.38 
 
 
264 aa  71.6  0.000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  25.78 
 
 
264 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  26.13 
 
 
265 aa  70.9  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  24.11 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  24.89 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  25.78 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  25.45 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  25.45 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  23.21 
 
 
268 aa  68.6  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1157  cobalt transport protein  36.71 
 
 
223 aa  68.2  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.930884  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0623  cobalt transport protein  35.15 
 
 
202 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303566  normal  0.0342119 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0846  cobalt transport protein  37.5 
 
 
198 aa  66.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  26.43 
 
 
264 aa  65.9  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  24.66 
 
 
269 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4129  cobalt transport protein  32.5 
 
 
191 aa  65.1  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.373392  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20540  Cobalt transport protein  31.16 
 
 
211 aa  64.3  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.85 
 
 
770 aa  63.5  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3805  cobalt transport protein  31.82 
 
 
282 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.829315  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  23.87 
 
 
267 aa  63.5  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0828  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  24.43 
 
 
255 aa  63.2  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.404494  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  25 
 
 
268 aa  63.2  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  27.15 
 
 
265 aa  62.8  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  29.55 
 
 
810 aa  62.4  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1702  cobalt transport protein  26.01 
 
 
265 aa  62  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0582  cobalt transport protein  32.49 
 
 
202 aa  61.2  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45764  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  22.51 
 
 
268 aa  61.2  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  22.51 
 
 
268 aa  61.2  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1751  cobalt transport protein  27.27 
 
 
272 aa  61.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253796  normal  0.0321598 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  23.35 
 
 
268 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2799  cobalt transport protein  29.41 
 
 
284 aa  60.5  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161091  hitchhiker  0.0000401783 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0077  cobalt transport protein  24.27 
 
 
246 aa  59.7  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.67532  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5032  cobalt transport protein  32.99 
 
 
205 aa  59.3  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.298232  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2913  cobalt transport protein  43.75 
 
 
218 aa  58.5  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.505117 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0997  cobalt transport protein  28.77 
 
 
264 aa  57.8  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  normal  0.445886 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  20.43 
 
 
269 aa  57.4  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1836  cobalt transport protein  26.01 
 
 
244 aa  57  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.507525  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4600  cobalt transport protein  28.93 
 
 
197 aa  56.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.610496  normal  0.640124 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12580  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  23.42 
 
 
269 aa  54.3  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  25.45 
 
 
269 aa  53.5  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  21.46 
 
 
262 aa  52.8  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2320  cobalt transport protein  29.7 
 
 
197 aa  52.4  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.593749  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0158  cobalt transport protein  29.72 
 
 
249 aa  52.4  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0929  cobalt transport protein  25.91 
 
 
271 aa  52  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000291148  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  27.14 
 
 
263 aa  52  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0247  cobalt transport protein  24.09 
 
 
269 aa  51.6  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.224698  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1539  cobalt transport protein  29.7 
 
 
197 aa  52  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0951  cobalt transport protein  26.36 
 
 
271 aa  50.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.222726  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0583  cobalt transport family protein  24.88 
 
 
257 aa  49.7  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24080  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  24.22 
 
 
266 aa  48.5  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0318  cobalt transport protein  23.64 
 
 
262 aa  48.5  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000082775  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2731  cobalt transport protein  29.09 
 
 
282 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2707  cobalt transport protein  22.97 
 
 
277 aa  48.1  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2764  cobalt transport protein  22.97 
 
 
277 aa  48.1  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>