50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2913 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2913  cobalt transport protein  100 
 
 		 218 aa  383  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.505117 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3351  cobalt transport protein  44.76 
 
 		 204 aa  114  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1853  cobalt transport protein  39.52 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00024219 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2111  cobalt transport protein  45.53 
 
 		 216 aa  97.8  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0552533  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1679  cobalt transport protein  42.44 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4656  cobalt transport protein  43.75 
 
 		 200 aa  90.5  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.365501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3226  cobalt transport protein  37.25 
 
 		 200 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2312  putative cobalt transport system permease protein  38.42 
 
 		 198 aa  87.8  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3687  cobalt transport protein  37.37 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.600557  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21860  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  42.72 
 
 		 227 aa  85.1  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172242  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0506  cobalt transport protein  45.67 
 
 		 204 aa  85.1  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5279  cobalt transport protein  37.25 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5368  cobalt transport protein  37.25 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.539179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5658  cobalt transport protein  37.25 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3462  cobalt transport protein  36.27 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1527  cobalt transport protein  44.88 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1194  putative biotin ABC transporter, permease protein  27.45 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3660  cobalt transport protein  32.02 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01760  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  35.47 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.975631 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3075  cobalt transport protein  36.95 
 
 		 198 aa  72  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1730  cobalt transport protein  31.88 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5458  cobalt transport protein  43.7 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00259272  normal  0.0904003 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3687  cobalt transport protein  33.33 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2004  cobalt transport protein  34.63 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.288516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1332  cobalt transport protein  39.7 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256618  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3288  cobalt transport protein  34.15 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.972587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1067  cobalt transport protein  35.45 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1157  cobalt transport protein  31.48 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.930884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2319  hypothetical protein  36.72 
 
 		 155 aa  52.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3805  cobalt transport protein  33.33 
 
 		 282 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.829315  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20540  Cobalt transport protein  31.03 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0623  cobalt transport protein  32.67 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303566  normal  0.0342119 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1006  ABC transporter membrane spanning protein  29.33 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0846  cobalt transport protein  35.16 
 
 		 198 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2731  cobalt transport protein  31.28 
 
 		 282 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2174  ABC transporter inner membrane protein  33.5 
 
 		 196 aa  45.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  25 
 
 		 267 aa  44.3  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4129  cobalt transport protein  40.52 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.373392  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3441  cobalt transport protein  34.62 
 
 		 280 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.389848 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3493  cobalt transport protein  34.62 
 
 		 280 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.229995  normal  0.210593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3430  cobalt transport protein  34.62 
 
 		 280 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  24.55 
 
 		 264 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  23.89 
 
 		 264 aa  42  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  23.81 
 
 		 267 aa  42  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0828  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  26.67 
 
 		 255 aa  42  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.404494  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  22.57 
 
 		 264 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  22.57 
 
 		 264 aa  41.6  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  22.57 
 
 		 264 aa  41.6  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  22.57 
 
 		 264 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  22.57 
 
 		 264 aa  41.6  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>