117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3687 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3687  cobalt transport protein  100 
 
 		 210 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.600557  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3660  cobalt transport protein  43.08 
 
 		 196 aa  143  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1194  putative biotin ABC transporter, permease protein  35.68 
 
 		 217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2004  cobalt transport protein  43.72 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.288516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1332  cobalt transport protein  42.86 
 
 		 241 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256618  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2312  putative cobalt transport system permease protein  38.58 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3351  cobalt transport protein  37.06 
 
 		 204 aa  105  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1067  cobalt transport protein  39.46 
 
 		 255 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2174  ABC transporter inner membrane protein  40.41 
 
 		 196 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3687  cobalt transport protein  34.87 
 
 		 197 aa  96.7  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5458  cobalt transport protein  44.67 
 
 		 201 aa  95.9  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00259272  normal  0.0904003 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3226  cobalt transport protein  37.63 
 
 		 200 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5279  cobalt transport protein  35.35 
 
 		 200 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5368  cobalt transport protein  35.35 
 
 		 200 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.539179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5658  cobalt transport protein  35.35 
 
 		 200 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3462  cobalt transport protein  37.63 
 
 		 200 aa  91.7  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1006  ABC transporter membrane spanning protein  34.67 
 
 		 206 aa  90.5  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0506  cobalt transport protein  42.27 
 
 		 204 aa  89.4  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1853  cobalt transport protein  33.65 
 
 		 212 aa  88.6  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00024219 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1679  cobalt transport protein  37.95 
 
 		 216 aa  87.4  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1730  cobalt transport protein  35.68 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4656  cobalt transport protein  37.63 
 
 		 200 aa  86.7  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.365501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01760  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  32.81 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.975631 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  26.39 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2111  cobalt transport protein  34.12 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0552533  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3288  cobalt transport protein  35.11 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.972587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3075  cobalt transport protein  34.02 
 
 		 198 aa  81.3  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0846  cobalt transport protein  40.41 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2319  hypothetical protein  38.1 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20540  Cobalt transport protein  33.81 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  35.05 
 
 		 264 aa  78.6  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21860  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  34.47 
 
 		 227 aa  78.2  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0623  cobalt transport protein  34.5 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303566  normal  0.0342119 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  27.73 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0929  cobalt transport protein  33.02 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000291148  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  27.47 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  27.47 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  26.61 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5032  cobalt transport protein  36.22 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.298232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  25.45 
 
 		 268 aa  72  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  25.91 
 
 		 268 aa  71.6  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0951  cobalt transport protein  31.63 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.222726  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0582  cobalt transport protein  35.03 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  28.57 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  28.57 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1157  cobalt transport protein  33.33 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.930884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1527  cobalt transport protein  39.3 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  26.69 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2320  cobalt transport protein  34.36 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.593749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  26.27 
 
 		 270 aa  68.6  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  25.86 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1539  cobalt transport protein  34.36 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0502  cobalt transport protein  35.35 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  26.78 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  26.27 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  26.27 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1947  cobalt ABC transporter permease protein  32 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.259406  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  24.55 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  27.03 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  25.85 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  25.85 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  25.85 
 
 		 264 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  25.85 
 
 		 264 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  25.85 
 
 		 264 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  25.85 
 
 		 264 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  25.85 
 
 		 264 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1964  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit  27.83 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  25.46 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4600  cobalt transport protein  32.84 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.610496  normal  0.640124 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0077  cobalt transport protein  27.49 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.67532  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0583  cobalt transport family protein  29.77 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4129  cobalt transport protein  34.17 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.373392  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  34.01 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  23.11 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12800  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  29.49 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  25.97 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  24.37 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1836  cobalt transport protein  25.85 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.507525  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  25.22 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3887  cobalt transport protein  26.02 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000020913  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  24.22 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0997  cobalt transport protein  31.08 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  normal  0.445886 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  26.22 
 
 		 810 aa  55.8  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1751  cobalt transport protein  29.46 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253796  normal  0.0321598 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  30.7 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  25.33 
 
 		 264 aa  54.7  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  28.31 
 
 		 269 aa  53.9  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0629  cobalt transport protein  28.33 
 
 		 438 aa  53.5  0.000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.35082  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0247  cobalt transport protein  29.22 
 
 		 269 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.224698  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2485  cobalt transport protein  29.09 
 
 		 256 aa  52.4  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.08544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0318  cobalt transport protein  26.03 
 
 		 262 aa  52.4  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000082775  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  24.44 
 
 		 264 aa  51.6  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  24.35 
 
 		 257 aa  51.2  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1702  cobalt transport protein  26.03 
 
 		 265 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  26.46 
 
 		 262 aa  50.1  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2799  cobalt transport protein  33.09 
 
 		 284 aa  49.7  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161091  hitchhiker  0.0000401783 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  32.61 
 
 		 265 aa  49.3  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1229  cobalt transport protein  28.81 
 
 		 322 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.379694 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  24.79 
 
 		 332 aa  48.9  0.00005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  20.45 
 
 		 269 aa  47.8  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>