79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3075 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3075  cobalt transport protein  100 
 
 
198 aa  381  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4656  cobalt transport protein  41.12 
 
 
200 aa  121  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.365501  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5458  cobalt transport protein  48.48 
 
 
201 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00259272  normal  0.0904003 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3687  cobalt transport protein  36.22 
 
 
210 aa  93.6  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.600557  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3226  cobalt transport protein  33.67 
 
 
200 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5658  cobalt transport protein  36.22 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5368  cobalt transport protein  36.22 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.539179  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5279  cobalt transport protein  36.22 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2312  putative cobalt transport system permease protein  34.01 
 
 
198 aa  88.2  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1730  cobalt transport protein  32.31 
 
 
200 aa  87.8  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3660  cobalt transport protein  32.32 
 
 
196 aa  84.3  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3351  cobalt transport protein  34.34 
 
 
204 aa  84  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3462  cobalt transport protein  35.23 
 
 
200 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1853  cobalt transport protein  33.17 
 
 
212 aa  79  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00024219 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01760  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  35.42 
 
 
209 aa  78.6  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.975631 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0506  cobalt transport protein  38.98 
 
 
204 aa  73.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2004  cobalt transport protein  32.08 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.288516  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1006  ABC transporter membrane spanning protein  32.52 
 
 
206 aa  68.2  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1527  cobalt transport protein  35.53 
 
 
208 aa  68.2  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1194  putative biotin ABC transporter, permease protein  23.86 
 
 
217 aa  68.2  0.00000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21860  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  31.58 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172242  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20540  Cobalt transport protein  35.55 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2111  cobalt transport protein  31.53 
 
 
216 aa  64.7  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0552533  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2319  hypothetical protein  40 
 
 
155 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2174  ABC transporter inner membrane protein  34 
 
 
196 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1332  cobalt transport protein  33.16 
 
 
241 aa  61.2  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256618  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0846  cobalt transport protein  41.84 
 
 
198 aa  58.9  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  30.91 
 
 
264 aa  58.9  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3687  cobalt transport protein  22.96 
 
 
197 aa  57  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  27.19 
 
 
265 aa  55.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4129  cobalt transport protein  29.5 
 
 
191 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.373392  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  24.2 
 
 
267 aa  53.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1679  cobalt transport protein  37.11 
 
 
216 aa  53.9  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  32.46 
 
 
266 aa  53.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  27.68 
 
 
269 aa  52.8  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2320  cobalt transport protein  35.71 
 
 
197 aa  52.8  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.593749  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  23.77 
 
 
268 aa  52.8  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  22.87 
 
 
268 aa  51.6  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  24.77 
 
 
266 aa  51.6  0.000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1539  cobalt transport protein  35.71 
 
 
197 aa  51.6  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  30.7 
 
 
268 aa  51.6  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  23.74 
 
 
269 aa  51.2  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  28.7 
 
 
263 aa  50.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  28.7 
 
 
263 aa  50.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  23.77 
 
 
267 aa  50.8  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  29.94 
 
 
263 aa  50.4  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.73 
 
 
770 aa  50.1  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  23.98 
 
 
264 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  23.98 
 
 
264 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  23.98 
 
 
264 aa  49.7  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  23.98 
 
 
264 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  23.98 
 
 
264 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  23.98 
 
 
264 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  23.98 
 
 
264 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5032  cobalt transport protein  33.65 
 
 
205 aa  48.9  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.298232  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  23.98 
 
 
264 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  23.98 
 
 
265 aa  48.5  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  28.44 
 
 
269 aa  47.4  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  23.08 
 
 
264 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  21.27 
 
 
266 aa  47  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  24.89 
 
 
265 aa  46.2  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0158  cobalt transport protein  29.9 
 
 
249 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1067  cobalt transport protein  30.21 
 
 
255 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  23.53 
 
 
264 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  26.83 
 
 
267 aa  45.1  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  23.64 
 
 
264 aa  43.9  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0318  cobalt transport protein  23.29 
 
 
262 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000082775  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  23.53 
 
 
264 aa  43.5  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0352  cobalt transport protein  36.04 
 
 
264 aa  43.1  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12580  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  25.23 
 
 
269 aa  42.7  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1947  cobalt ABC transporter permease protein  28.57 
 
 
259 aa  43.1  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.259406  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4600  cobalt transport protein  27.41 
 
 
197 aa  42.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.610496  normal  0.640124 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3288  cobalt transport protein  27.43 
 
 
249 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.972587  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  25.22 
 
 
267 aa  42  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  26.55 
 
 
264 aa  41.6  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  34.94 
 
 
810 aa  41.2  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  24.56 
 
 
268 aa  41.6  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  24.56 
 
 
268 aa  41.6  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2300  cobalt ABC transporter permease protein  28 
 
 
263 aa  41.2  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000489641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>