87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_5032 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_5032  cobalt transport protein  100 
 
 		 205 aa  391  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.298232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2174  ABC transporter inner membrane protein  55.84 
 
 		 196 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0846  cobalt transport protein  57.36 
 
 		 198 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2319  hypothetical protein  58.67 
 
 		 155 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2004  cobalt transport protein  40.86 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.288516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1006  ABC transporter membrane spanning protein  35.68 
 
 		 206 aa  85.5  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3687  cobalt transport protein  36.08 
 
 		 210 aa  85.1  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.600557  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1194  putative biotin ABC transporter, permease protein  30.61 
 
 		 217 aa  84.7  9e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3660  cobalt transport protein  31.98 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2312  putative cobalt transport system permease protein  32.65 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1730  cobalt transport protein  38.69 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1539  cobalt transport protein  35.03 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2320  cobalt transport protein  35.53 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.593749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3226  cobalt transport protein  32.61 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4600  cobalt transport protein  32.32 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.610496  normal  0.640124 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01760  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  32.23 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.975631 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0506  cobalt transport protein  32.58 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1332  cobalt transport protein  36.07 
 
 		 241 aa  62  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256618  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  28.15 
 
 		 268 aa  61.6  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  28.15 
 
 		 268 aa  61.6  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3462  cobalt transport protein  36.7 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  30.6 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  30.6 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1527  cobalt transport protein  36.36 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3687  cobalt transport protein  28.88 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1679  cobalt transport protein  34.86 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  24.48 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5658  cobalt transport protein  34.72 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5279  cobalt transport protein  34.72 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5368  cobalt transport protein  34.72 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.539179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4656  cobalt transport protein  36.08 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.365501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  21.56 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  35.96 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5458  cobalt transport protein  36.8 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00259272  normal  0.0904003 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  31.45 
 
 		 266 aa  53.9  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2111  cobalt transport protein  27.92 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0552533  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1067  cobalt transport protein  30.98 
 
 		 255 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3351  cobalt transport protein  30.3 
 
 		 204 aa  51.6  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1702  cobalt transport protein  26.76 
 
 		 265 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20540  Cobalt transport protein  31.69 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  27.97 
 
 		 268 aa  49.3  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  25.19 
 
 		 269 aa  49.7  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1853  cobalt transport protein  27.94 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00024219 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  23.93 
 
 		 268 aa  49.3  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  25.41 
 
 		 264 aa  48.9  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2470  cobalt transport protein  25.46 
 
 		 275 aa  48.9  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105266  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  24.14 
 
 		 268 aa  48.9  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0623  cobalt transport protein  30.98 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303566  normal  0.0342119 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  24.19 
 
 		 270 aa  48.5  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1157  cobalt transport protein  27.86 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.930884  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  24.79 
 
 		 332 aa  47.8  0.0001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1947  cobalt ABC transporter permease protein  23.63 
 
 		 259 aa  47.8  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.259406  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1751  cobalt transport protein  27.98 
 
 		 272 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253796  normal  0.0321598 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  26.79 
 
 		 267 aa  46.6  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21860  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  29.9 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  26.2 
 
 		 265 aa  45.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1229  cobalt transport protein  32.05 
 
 		 322 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.379694 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.91 
 
 		 770 aa  45.8  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3075  cobalt transport protein  33.65 
 
 		 198 aa  45.8  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  23.7 
 
 		 267 aa  45.1  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  22.5 
 
 		 269 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0828  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  21.51 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.404494  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  24.65 
 
 		 269 aa  44.3  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0951  cobalt transport protein  25.69 
 
 		 271 aa  43.5  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.222726  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  25 
 
 		 264 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0929  cobalt transport protein  25.23 
 
 		 271 aa  43.5  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000291148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  25.2 
 
 		 310 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  27.91 
 
 		 265 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0884  cobalt transport protein  29.49 
 
 		 291 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2867  cobalt transport protein  30.77 
 
 		 290 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3229  cobalt transport protein  30.77 
 
 		 290 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.500857 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  23.89 
 
 		 264 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  23.53 
 
 		 267 aa  42.4  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  23.89 
 
 		 264 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  23.89 
 
 		 264 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  23.89 
 
 		 264 aa  42.4  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  23.89 
 
 		 264 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  23.89 
 
 		 264 aa  42  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  23.89 
 
 		 264 aa  42  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  23.89 
 
 		 264 aa  42  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  23.89 
 
 		 264 aa  42  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3805  cobalt transport protein  31.15 
 
 		 282 aa  41.6  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.829315  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  24.18 
 
 		 265 aa  41.2  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0629  cobalt transport protein  21.85 
 
 		 438 aa  41.2  0.01  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.35082  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3430  cobalt transport protein  31.5 
 
 		 280 aa  41.2  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3441  cobalt transport protein  31.5 
 
 		 280 aa  41.2  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.389848 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3493  cobalt transport protein  31.5 
 
 		 280 aa  41.2  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.229995  normal  0.210593 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>