88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2004 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2004  cobalt transport protein  100 
 
 		 214 aa  402  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.288516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3687  cobalt transport protein  44.08 
 
 		 210 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.600557  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2174  ABC transporter inner membrane protein  42.16 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3226  cobalt transport protein  40.89 
 
 		 200 aa  102  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0846  cobalt transport protein  43.08 
 
 		 198 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3660  cobalt transport protein  34.17 
 
 		 196 aa  95.1  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2319  hypothetical protein  39.74 
 
 		 155 aa  92.4  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1853  cobalt transport protein  33.98 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00024219 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1730  cobalt transport protein  37.44 
 
 		 200 aa  88.2  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5032  cobalt transport protein  39.8 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.298232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2312  putative cobalt transport system permease protein  32.65 
 
 		 198 aa  85.5  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3462  cobalt transport protein  37.56 
 
 		 200 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5658  cobalt transport protein  37.31 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5279  cobalt transport protein  37.31 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5368  cobalt transport protein  37.31 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.539179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2111  cobalt transport protein  30.81 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0552533  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1194  putative biotin ABC transporter, permease protein  30.1 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1539  cobalt transport protein  35.2 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2320  cobalt transport protein  35.71 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.593749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3687  cobalt transport protein  31.77 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1332  cobalt transport protein  39.41 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256618  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4600  cobalt transport protein  34.38 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.610496  normal  0.640124 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0506  cobalt transport protein  36.84 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1006  ABC transporter membrane spanning protein  32.84 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3351  cobalt transport protein  33.33 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1679  cobalt transport protein  34.85 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3075  cobalt transport protein  33.33 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1067  cobalt transport protein  30.81 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5458  cobalt transport protein  40 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00259272  normal  0.0904003 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1751  cobalt transport protein  32.16 
 
 		 272 aa  58.5  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253796  normal  0.0321598 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4656  cobalt transport protein  35.35 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.365501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  27.15 
 
 		 810 aa  57  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  28.68 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  29.22 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  30.23 
 
 		 268 aa  55.1  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21860  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  33.16 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3288  cobalt transport protein  31.43 
 
 		 249 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.972587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  24.89 
 
 		 267 aa  55.1  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  23.81 
 
 		 770 aa  54.7  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  26.61 
 
 		 269 aa  53.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0589  ABC-type cobalt transport system  32.11 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0946935  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  23.28 
 
 		 268 aa  53.1  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  22.84 
 
 		 268 aa  52.4  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0502  cobalt transport protein  34.83 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  27.56 
 
 		 266 aa  51.6  0.000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1947  cobalt ABC transporter permease protein  24.46 
 
 		 259 aa  52  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.259406  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  24.78 
 
 		 267 aa  51.6  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3229  cobalt transport protein  27.34 
 
 		 290 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.500857 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01760  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  30.65 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.975631 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2867  cobalt transport protein  27.34 
 
 		 290 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0623  cobalt transport protein  31.82 
 
 		 202 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303566  normal  0.0342119 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  24.55 
 
 		 268 aa  48.9  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  24.55 
 
 		 268 aa  48.9  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  30.61 
 
 		 266 aa  48.5  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1964  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit  26.48 
 
 		 255 aa  48.5  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1157  cobalt transport protein  29.03 
 
 		 223 aa  48.1  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.930884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0828  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  24 
 
 		 255 aa  47.8  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.404494  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2799  cobalt transport protein  29.69 
 
 		 284 aa  47  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161091  hitchhiker  0.0000401783 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0582  cobalt transport protein  29.45 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1527  cobalt transport protein  34.34 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  24.55 
 
 		 264 aa  46.6  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  24.55 
 
 		 264 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  23.32 
 
 		 262 aa  46.2  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  27.23 
 
 		 265 aa  45.8  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  26.89 
 
 		 267 aa  45.8  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3565  cobalt transport protein  25.78 
 
 		 309 aa  45.4  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0616568  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  24.55 
 
 		 264 aa  45.4  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1702  cobalt transport protein  26.87 
 
 		 265 aa  45.4  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  24.55 
 
 		 264 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  24.55 
 
 		 264 aa  45.4  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  24.55 
 
 		 264 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  24.55 
 
 		 264 aa  45.4  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4901  cobalt transport protein  27.87 
 
 		 334 aa  45.1  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.703439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  28.32 
 
 		 263 aa  44.7  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1229  cobalt transport protein  25.76 
 
 		 322 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.379694 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  28.32 
 
 		 263 aa  44.7  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  24.55 
 
 		 264 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  25.45 
 
 		 264 aa  44.3  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  27.59 
 
 		 268 aa  43.9  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  29.84 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0884  cobalt transport protein  26.56 
 
 		 291 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  24.11 
 
 		 264 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  24.11 
 
 		 264 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3887  cobalt transport protein  23.6 
 
 		 270 aa  42.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000020913  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  23.66 
 
 		 264 aa  42.4  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1637  cobalt transport protein  27.63 
 
 		 268 aa  42  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.125207  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0247  cobalt transport protein  30.93 
 
 		 269 aa  41.6  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.224698  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  22.32 
 
 		 264 aa  41.6  0.01  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>