90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0589 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0589  ABC-type cobalt transport system  100 
 
 		 258 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0946935  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0253  cobalt transport protein  72.87 
 
 		 313 aa  317  1e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.648323  normal  0.0540671 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3823  cobalt transport protein  45.56 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457934  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3444  cobalt transport protein  44.08 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2044  cobalt transport protein  41.73 
 
 		 264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3649  cobalt transport protein  36.18 
 
 		 266 aa  123  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3864  cobalt transport protein  35.77 
 
 		 267 aa  120  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5361  cobalt transport protein  41.48 
 
 		 258 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5272  cobalt transport protein  41.48 
 
 		 258 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5651  cobalt transport protein  41.23 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.263565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0821  cobalt ABC transporter permease  33.86 
 
 		 275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.505848  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0414  cobalt transport protein  34.8 
 
 		 895 aa  108  9.000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.624811 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0972  cobalt transport protein  38.14 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  30.36 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4235  cobalt transport protein  36.61 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08030  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  31.92 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  25.77 
 
 		 267 aa  62  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  24.81 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  24.81 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0077  cobalt transport protein  25.86 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.67532  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0660  cobalt transport family protein  24.66 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.11691  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  24.42 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  24.42 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  24.42 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  24.42 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  24.42 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  24.42 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  24.42 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1950  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporters-like protein  32.41 
 
 		 241 aa  58.5  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  23.64 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0091  cobalt transport protein  27.91 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0139648  normal  0.284452 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  25.93 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  25.93 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1157  cobalt transport protein  25.23 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1135  cobalt transport protein  25.23 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  26.71 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0838  hypothetical protein  25.23 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.103141  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1879  cobalt transport protein  26.83 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.200735  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2004  cobalt transport protein  32.11 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.288516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  29.37 
 
 		 267 aa  53.5  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07520  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  28.21 
 
 		 270 aa  53.1  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.508014 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1545  cobalt transport protein  30.94 
 
 		 276 aa  52.8  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.679113  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  26.42 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11750  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  44.8 
 
 		 656 aa  51.6  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.348562  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1768  ABC transporter, permease protein  27.78 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.689624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0226  cobalt transport protein  28.63 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  27.1 
 
 		 267 aa  50.4  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0609  cobalt transport protein  29.03 
 
 		 261 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3865  cobalt transport protein  30.83 
 
 		 227 aa  50.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0766  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  25.93 
 
 		 213 aa  50.1  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.156344  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3139  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.85 
 
 		 255 aa  50.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.122579  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1539  cobalt transport protein  28.57 
 
 		 245 aa  50.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0682  cobalt transport protein  30.49 
 
 		 248 aa  49.7  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000924748  normal  0.134467 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0712  cobalt transport protein  27.65 
 
 		 243 aa  48.9  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  28.66 
 
 		 263 aa  48.9  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0370  cobalt transport protein  30 
 
 		 253 aa  48.9  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3958  cobalt transport protein  30.83 
 
 		 227 aa  48.9  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23320  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  30.25 
 
 		 811 aa  48.5  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0091  cobalt transport protein  30.3 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1413  cobalt transport protein  27.19 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0828  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  24.79 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.404494  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1302  cobalt transport protein  26.36 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0789486  normal  0.0436887 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19680  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  29.75 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0554754  normal  0.221391 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0096  cobalt transport protein  27.34 
 
 		 221 aa  46.6  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4448  cobalt transport protein  30.3 
 
 		 226 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2485  cobalt transport protein  26.45 
 
 		 256 aa  46.2  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.08544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0066  cobalt transport protein  29.14 
 
 		 238 aa  45.8  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4253  cobalt transport protein  29.55 
 
 		 226 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4308  cobalt transport protein  29.55 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  24.66 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12580  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  32.22 
 
 		 269 aa  45.4  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01470  Cobalt transport protein  30.97 
 
 		 350 aa  44.7  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0260035  normal  0.244881 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  26.96 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12800  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  27.2 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  26.45 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2677  cobalt transport protein  28.43 
 
 		 287 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.503395  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1922  cobalt transport protein  28.5 
 
 		 221 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.493439  hitchhiker  0.00315513 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1834  putative cobalt ABC transporter, permease protein  20.86 
 
 		 273 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  22.56 
 
 		 273 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8786  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporter-like protein  30.91 
 
 		 272 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1488  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  24.42 
 
 		 213 aa  43.1  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.308498  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1150  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  23.56 
 
 		 266 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1788  cobalt transport protein  23.65 
 
 		 291 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.121417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  25.16 
 
 		 268 aa  42.7  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1760  cobalt transport protein  23.65 
 
 		 291 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  26.92 
 
 		 269 aa  42.7  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  26.55 
 
 		 265 aa  42.7  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  23.72 
 
 		 264 aa  42.4  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07620  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  32.71 
 
 		 276 aa  42.4  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5234  cobalt transport protein  24.62 
 
 		 283 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>