55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0066 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0066  cobalt transport protein  100 
 
 
238 aa  470  1e-132  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3823  cobalt transport protein  30.47 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457934  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3444  cobalt transport protein  32.33 
 
 
265 aa  64.3  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07520  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  28.19 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.508014 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5272  cobalt transport protein  34.13 
 
 
258 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5651  cobalt transport protein  34.13 
 
 
258 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.263565  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5361  cobalt transport protein  34.13 
 
 
258 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001241  transmembrane component MtsC of energizing module of methionine-regulated ECF transporter  33.96 
 
 
279 aa  58.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529253  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05107  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ  32.08 
 
 
279 aa  55.8  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0972  cobalt transport protein  33.03 
 
 
249 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0712  cobalt transport protein  26.58 
 
 
243 aa  55.5  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07620  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  28.4 
 
 
276 aa  55.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0414  cobalt transport protein  29.2 
 
 
895 aa  54.7  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.624811 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3473  cobalt transport protein  28.69 
 
 
259 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3864  cobalt transport protein  29.69 
 
 
267 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0821  cobalt ABC transporter permease  31.01 
 
 
275 aa  53.5  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.505848  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1768  ABC transporter, permease protein  31.48 
 
 
297 aa  52.8  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.689624  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  26.97 
 
 
332 aa  52.4  0.000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1950  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporters-like protein  33.33 
 
 
241 aa  51.6  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1834  putative cobalt ABC transporter, permease protein  23.74 
 
 
273 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  24.26 
 
 
269 aa  50.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  23.74 
 
 
273 aa  50.1  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2707  cobalt transport protein  27.35 
 
 
277 aa  49.7  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2764  cobalt transport protein  27.35 
 
 
277 aa  49.7  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5234  cobalt transport protein  27.68 
 
 
283 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1972  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  27.12 
 
 
275 aa  48.9  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2044  cobalt transport protein  28.89 
 
 
264 aa  48.9  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25955  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3649  cobalt transport protein  29.41 
 
 
266 aa  48.5  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2111  cobalt transport protein  31.67 
 
 
253 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.105406  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2704  cobalt transport protein  26.32 
 
 
285 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0253  cobalt transport protein  27.08 
 
 
313 aa  47  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.648323  normal  0.0540671 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0589  ABC-type cobalt transport system  28.25 
 
 
258 aa  46.2  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0946935  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  30.23 
 
 
764 aa  46.6  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4235  cobalt transport protein  27.33 
 
 
294 aa  46.6  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0609  cobalt transport protein  26.19 
 
 
261 aa  45.4  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0348  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  30.19 
 
 
276 aa  45.4  0.0008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1545  cobalt transport protein  28 
 
 
276 aa  45.1  0.0009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.679113  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3136  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.69 
 
 
255 aa  45.1  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1990  putative cobalt transport protein  30.19 
 
 
279 aa  45.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024453  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  26.53 
 
 
263 aa  44.7  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0260  hypothetical protein  29.2 
 
 
266 aa  45.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.79252  normal  0.480643 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12800  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  24.39 
 
 
256 aa  45.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1539  cobalt transport protein  24.67 
 
 
245 aa  43.9  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  24.53 
 
 
267 aa  44.3  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2688  cobalt transport protein  29.32 
 
 
321 aa  44.3  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0337  cobalt transport protein  26.85 
 
 
256 aa  43.5  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0226  cobalt transport protein  27.14 
 
 
262 aa  43.5  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1879  cobalt transport protein  24.63 
 
 
252 aa  43.5  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.200735  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  25.23 
 
 
269 aa  42.7  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0583  cobalt transport family protein  26.85 
 
 
257 aa  42.7  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1302  cobalt transport protein  26.32 
 
 
267 aa  42.4  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0789486  normal  0.0436887 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0027  hypothetical protein  26.5 
 
 
255 aa  42.4  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2822  cobalt transport protein  24.5 
 
 
261 aa  42  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1741  cobalt transport protein  36.99 
 
 
242 aa  42  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.645456  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  22.27 
 
 
268 aa  41.6  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>