111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0253 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0253  cobalt transport protein  100 
 
 		 313 aa  585  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.648323  normal  0.0540671 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0589  ABC-type cobalt transport system  72.87 
 
 		 258 aa  328  8e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0946935  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3823  cobalt transport protein  42.58 
 
 		 266 aa  152  8.999999999999999e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457934  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3444  cobalt transport protein  42.86 
 
 		 265 aa  138  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2044  cobalt transport protein  40.94 
 
 		 264 aa  126  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3649  cobalt transport protein  36.84 
 
 		 266 aa  124  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3864  cobalt transport protein  35.48 
 
 		 267 aa  122  9e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5272  cobalt transport protein  43.42 
 
 		 258 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5361  cobalt transport protein  43.42 
 
 		 258 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5651  cobalt transport protein  43.17 
 
 		 258 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.263565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0821  cobalt ABC transporter permease  35.53 
 
 		 275 aa  112  6e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.505848  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0414  cobalt transport protein  32 
 
 		 895 aa  105  1e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.624811 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0972  cobalt transport protein  39.63 
 
 		 249 aa  99  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4235  cobalt transport protein  38.65 
 
 		 294 aa  85.5  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  26.97 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  26.97 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  26.56 
 
 		 264 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  26.56 
 
 		 264 aa  72  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  26.56 
 
 		 264 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  26.56 
 
 		 264 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  26.16 
 
 		 264 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  26.56 
 
 		 264 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  26.16 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  26.16 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  28.28 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  25.73 
 
 		 264 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0077  cobalt transport protein  26.53 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.67532  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0660  cobalt transport family protein  23.7 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.11691  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1135  cobalt transport protein  25.78 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1157  cobalt transport protein  25.78 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1879  cobalt transport protein  30.28 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.200735  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  30 
 
 		 268 aa  57  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  24.22 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0226  cobalt transport protein  32.88 
 
 		 262 aa  55.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  28.75 
 
 		 268 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2485  cobalt transport protein  31.54 
 
 		 256 aa  55.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.08544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0091  cobalt transport protein  32.17 
 
 		 226 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0712  cobalt transport protein  27.88 
 
 		 243 aa  53.5  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  22.89 
 
 		 268 aa  53.5  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  22.89 
 
 		 268 aa  53.5  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  29.3 
 
 		 267 aa  53.5  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23320  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  36.28 
 
 		 811 aa  53.5  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0766  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  27.43 
 
 		 213 aa  53.1  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.156344  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4448  cobalt transport protein  32.87 
 
 		 226 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3865  cobalt transport protein  30.88 
 
 		 227 aa  52.8  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  30.77 
 
 		 266 aa  52.8  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0609  cobalt transport protein  27.35 
 
 		 261 aa  52.8  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  25.52 
 
 		 268 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1950  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporters-like protein  31.29 
 
 		 241 aa  52.4  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2677  cobalt transport protein  34.95 
 
 		 287 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.503395  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0096  cobalt transport protein  30.06 
 
 		 221 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4253  cobalt transport protein  32.17 
 
 		 226 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  28.78 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3958  cobalt transport protein  30.88 
 
 		 227 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1545  cobalt transport protein  31.58 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.679113  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  28.4 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4308  cobalt transport protein  32.17 
 
 		 226 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19680  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  28.88 
 
 		 231 aa  51.6  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0554754  normal  0.221391 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0091  cobalt transport protein  29.36 
 
 		 258 aa  50.8  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0139648  normal  0.284452 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1302  cobalt transport protein  28.57 
 
 		 267 aa  50.4  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0789486  normal  0.0436887 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1836  cobalt transport protein  25.13 
 
 		 244 aa  50.1  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.507525  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07620  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  32.67 
 
 		 276 aa  49.3  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1834  putative cobalt ABC transporter, permease protein  22.44 
 
 		 273 aa  48.9  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07520  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  26.23 
 
 		 270 aa  48.9  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.508014 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0066  cobalt transport protein  27.08 
 
 		 238 aa  47.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4408  cobalt transport protein  31.51 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.371368  normal  0.0141186 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  30.57 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11750  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  41.73 
 
 		 656 aa  48.5  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.348562  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  26.2 
 
 		 264 aa  47.8  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1768  ABC transporter, permease protein  29.33 
 
 		 297 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.689624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  23.45 
 
 		 273 aa  47.4  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1972  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  26.83 
 
 		 275 aa  47.4  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01470  Cobalt transport protein  33.33 
 
 		 350 aa  47.4  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0260035  normal  0.244881 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12580  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  33.33 
 
 		 269 aa  47.4  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2386  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  24.34 
 
 		 287 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00268022  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  28.17 
 
 		 269 aa  47  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  32.9 
 
 		 263 aa  47  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  32.9 
 
 		 263 aa  47  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0682  cobalt transport protein  29.7 
 
 		 248 aa  47  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000924748  normal  0.134467 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2659  cobalt transport protein  23.68 
 
 		 266 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000035997 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12800  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  29.14 
 
 		 256 aa  46.6  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0838  hypothetical protein  27.78 
 
 		 233 aa  46.2  0.0008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.103141  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  30.9 
 
 		 269 aa  45.8  0.0008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2669  cobalt transport protein  25.36 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00761496  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1457  cobalt transport protein  33.09 
 
 		 309 aa  45.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0828  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  24 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.404494  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  31.03 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1488  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  25.57 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.308498  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  28.87 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2710  cobalt transport protein  25.36 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2425  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  23.68 
 
 		 287 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434651  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08030  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  31.68 
 
 		 267 aa  44.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8786  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporter-like protein  31.29 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1413  cobalt transport protein  31.78 
 
 		 260 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0951  cobalt transport protein  32.08 
 
 		 271 aa  45.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.222726  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5234  cobalt transport protein  25.15 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  27.21 
 
 		 265 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2462  cobalt transport protein  23.25 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2642  cobalt transport protein  23.25 
 
 		 273 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.357292  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1257  cobalt transport protein  26.71 
 
 		 259 aa  44.3  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000290738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>