21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3958 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3958  cobalt transport protein  100 
 
 		 227 aa  454  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3865  cobalt transport protein  99.12 
 
 		 227 aa  450  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4448  cobalt transport protein  85.46 
 
 		 226 aa  340  1e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4308  cobalt transport protein  85.02 
 
 		 226 aa  338  4e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4253  cobalt transport protein  85.02 
 
 		 226 aa  336  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0091  cobalt transport protein  85.02 
 
 		 226 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0133  cobalt transport protein  65.19 
 
 		 230 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0096  cobalt transport protein  58.89 
 
 		 221 aa  224  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4086  cobalt transport protein  56.59 
 
 		 223 aa  221  7e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3674  cobalt transport protein  50.48 
 
 		 217 aa  174  9e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0133  hypothetical protein  44.1 
 
 		 223 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1539  cobalt transport protein  34.93 
 
 		 245 aa  98.2  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2395  ABC-type transport system, permease component  31.68 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1475  cobalt transport protein  32.89 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000182828 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0253  cobalt transport protein  29.45 
 
 		 313 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.648323  normal  0.0540671 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1760  cobalt transport protein  30 
 
 		 291 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1788  cobalt transport protein  30 
 
 		 291 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.121417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0589  ABC-type cobalt transport system  30.83 
 
 		 258 aa  47.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0946935  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0077  cobalt transport protein  27.27 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.67532  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1836  cobalt transport protein  24 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.507525  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0007  cobalt transport protein  27.93 
 
 		 258 aa  42  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>