21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4308 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_4308  cobalt transport protein  100 
 
 
226 aa  450  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4448  cobalt transport protein  98.67 
 
 
226 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4253  cobalt transport protein  98.23 
 
 
226 aa  440  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0091  cobalt transport protein  97.79 
 
 
226 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3865  cobalt transport protein  83.7 
 
 
227 aa  352  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3958  cobalt transport protein  82.82 
 
 
227 aa  349  2e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0133  cobalt transport protein  64.64 
 
 
230 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0096  cobalt transport protein  55.09 
 
 
221 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4086  cobalt transport protein  54.22 
 
 
223 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3674  cobalt transport protein  52.38 
 
 
217 aa  177  9e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0133  hypothetical protein  43.14 
 
 
223 aa  148  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1539  cobalt transport protein  34.22 
 
 
245 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2395  ABC-type transport system, permease component  31.31 
 
 
253 aa  79.3  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1475  cobalt transport protein  31.94 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000182828 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0077  cobalt transport protein  25.48 
 
 
246 aa  54.7  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.67532  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0253  cobalt transport protein  32.75 
 
 
313 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.648323  normal  0.0540671 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1836  cobalt transport protein  22.54 
 
 
244 aa  49.3  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.507525  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0589  ABC-type cobalt transport system  28 
 
 
258 aa  47  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0946935  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1760  cobalt transport protein  28.74 
 
 
291 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1788  cobalt transport protein  28.74 
 
 
291 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.121417  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  27.06 
 
 
257 aa  41.6  0.009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>