24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3865 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3865  cobalt transport protein  100 
 
 		 227 aa  454  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3958  cobalt transport protein  99.12 
 
 		 227 aa  450  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4448  cobalt transport protein  86.34 
 
 		 226 aa  343  1e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4308  cobalt transport protein  85.9 
 
 		 226 aa  341  5e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0091  cobalt transport protein  85.9 
 
 		 226 aa  340  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4253  cobalt transport protein  85.9 
 
 		 226 aa  340  1e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0133  cobalt transport protein  66.3 
 
 		 230 aa  238  5e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0096  cobalt transport protein  60 
 
 		 221 aa  227  9e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4086  cobalt transport protein  57.56 
 
 		 223 aa  224  8e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3674  cobalt transport protein  51.43 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0133  hypothetical protein  44.62 
 
 		 223 aa  148  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1539  cobalt transport protein  35.62 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2395  ABC-type transport system, permease component  32.18 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1475  cobalt transport protein  33.56 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000182828 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0253  cobalt transport protein  29.45 
 
 		 313 aa  51.6  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.648323  normal  0.0540671 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0077  cobalt transport protein  28.41 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.67532  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0589  ABC-type cobalt transport system  30.83 
 
 		 258 aa  49.3  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0946935  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1760  cobalt transport protein  28.89 
 
 		 291 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1788  cobalt transport protein  28.89 
 
 		 291 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.121417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1836  cobalt transport protein  23.2 
 
 		 244 aa  46.2  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.507525  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4125  cobalt transport protein  29.9 
 
 		 217 aa  42.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.902173  hitchhiker  0.0000589617 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3444  cobalt transport protein  26.51 
 
 		 265 aa  42.4  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0682  cobalt transport protein  30.38 
 
 		 248 aa  42  0.008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000924748  normal  0.134467 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0007  cobalt transport protein  27.93 
 
 		 258 aa  41.6  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>