29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0096 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0096  cobalt transport protein  100 
 
 		 221 aa  447  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0133  cobalt transport protein  69.44 
 
 		 230 aa  300  1e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4086  cobalt transport protein  62.43 
 
 		 223 aa  224  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3865  cobalt transport protein  59.39 
 
 		 227 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0091  cobalt transport protein  64.2 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4448  cobalt transport protein  64.2 
 
 		 226 aa  222  4e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4253  cobalt transport protein  63.58 
 
 		 226 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3958  cobalt transport protein  57.73 
 
 		 227 aa  219  3e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4308  cobalt transport protein  62.96 
 
 		 226 aa  218  7e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3674  cobalt transport protein  52.53 
 
 		 217 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0133  hypothetical protein  47.95 
 
 		 223 aa  136  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1539  cobalt transport protein  31.61 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1475  cobalt transport protein  34.19 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000182828 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2395  ABC-type transport system, permease component  33.33 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0253  cobalt transport protein  30.06 
 
 		 313 aa  52  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.648323  normal  0.0540671 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0077  cobalt transport protein  26.53 
 
 		 246 aa  50.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.67532  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2485  cobalt transport protein  25.56 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.08544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0589  ABC-type cobalt transport system  27.34 
 
 		 258 aa  47  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0946935  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0682  cobalt transport protein  26.97 
 
 		 248 aa  45.8  0.0006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000924748  normal  0.134467 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3551  cobalt ABC transporter, permease protein  26.13 
 
 		 287 aa  45.1  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401892  normal  0.225242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4125  cobalt transport protein  27.14 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.902173  hitchhiker  0.0000589617 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0348  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  29.41 
 
 		 276 aa  43.9  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2654  cobalt transport protein  26.2 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.36556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  27.38 
 
 		 810 aa  42.7  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1632  cobalt transport family protein  30.39 
 
 		 276 aa  42.7  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1972  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  26.4 
 
 		 275 aa  42.4  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0828  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  24.71 
 
 		 255 aa  42.4  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.404494  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  22.58 
 
 		 257 aa  42.4  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0007  cobalt transport protein  34.91 
 
 		 258 aa  42  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>