18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4086 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_4086  cobalt transport protein  100 
 
 		 223 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0133  cobalt transport protein  63.19 
 
 		 230 aa  246  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0096  cobalt transport protein  62.22 
 
 		 221 aa  236  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3865  cobalt transport protein  57.56 
 
 		 227 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3958  cobalt transport protein  56.59 
 
 		 227 aa  231  5e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0091  cobalt transport protein  55.56 
 
 		 226 aa  222  4e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4448  cobalt transport protein  55.56 
 
 		 226 aa  221  8e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4253  cobalt transport protein  55.11 
 
 		 226 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4308  cobalt transport protein  54.67 
 
 		 226 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3674  cobalt transport protein  56.1 
 
 		 217 aa  198  6e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0133  hypothetical protein  39.8 
 
 		 223 aa  131  9e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1539  cobalt transport protein  34.07 
 
 		 245 aa  92.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1475  cobalt transport protein  34.46 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000182828 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2395  ABC-type transport system, permease component  30.65 
 
 		 253 aa  78.2  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0077  cobalt transport protein  25.9 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.67532  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  26.09 
 
 		 257 aa  44.3  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3444  cobalt transport protein  26.4 
 
 		 265 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1879  cobalt transport protein  25.37 
 
 		 252 aa  42  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.200735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>