23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1475 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1475  cobalt transport protein  100 
 
 		 223 aa  441  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000182828 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2395  ABC-type transport system, permease component  36.84 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1539  cobalt transport protein  36.55 
 
 		 245 aa  115  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0133  cobalt transport protein  32.56 
 
 		 230 aa  89.4  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0133  hypothetical protein  39.22 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0096  cobalt transport protein  34.19 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4086  cobalt transport protein  34.46 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3865  cobalt transport protein  32.52 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4253  cobalt transport protein  32.64 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3958  cobalt transport protein  31.9 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0091  cobalt transport protein  32.64 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4448  cobalt transport protein  32.64 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3674  cobalt transport protein  36 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4308  cobalt transport protein  31.94 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  30.71 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1157  cobalt transport protein  27.27 
 
 		 268 aa  43.5  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1135  cobalt transport protein  27.27 
 
 		 268 aa  43.5  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07620  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  26.03 
 
 		 276 aa  43.5  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1768  ABC transporter, permease protein  29.1 
 
 		 297 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.689624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  26.26 
 
 		 263 aa  42.4  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  26.04 
 
 		 273 aa  42.4  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0682  cobalt transport protein  32.91 
 
 		 248 aa  42.4  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000924748  normal  0.134467 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1834  putative cobalt ABC transporter, permease protein  26.04 
 
 		 273 aa  41.6  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>