25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4448 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_4448  cobalt transport protein  100 
 
 
226 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4308  cobalt transport protein  98.67 
 
 
226 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0091  cobalt transport protein  98.23 
 
 
226 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4253  cobalt transport protein  98.67 
 
 
226 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3865  cobalt transport protein  84.14 
 
 
227 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3958  cobalt transport protein  83.26 
 
 
227 aa  352  2e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0133  cobalt transport protein  65.19 
 
 
230 aa  237  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0096  cobalt transport protein  56.02 
 
 
221 aa  229  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4086  cobalt transport protein  55.11 
 
 
223 aa  224  6e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3674  cobalt transport protein  53.33 
 
 
217 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0133  hypothetical protein  43.14 
 
 
223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1539  cobalt transport protein  34.76 
 
 
245 aa  105  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2395  ABC-type transport system, permease component  32.32 
 
 
253 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1475  cobalt transport protein  32.64 
 
 
223 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000182828 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0077  cobalt transport protein  25.48 
 
 
246 aa  55.1  0.0000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.67532  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0253  cobalt transport protein  30.71 
 
 
313 aa  53.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.648323  normal  0.0540671 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1836  cobalt transport protein  23.24 
 
 
244 aa  50.1  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.507525  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0589  ABC-type cobalt transport system  28.57 
 
 
258 aa  48.9  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0946935  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1760  cobalt transport protein  26.12 
 
 
291 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1788  cobalt transport protein  26.12 
 
 
291 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.121417  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3444  cobalt transport protein  29.13 
 
 
265 aa  43.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  26.97 
 
 
257 aa  43.1  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0682  cobalt transport protein  27.84 
 
 
248 aa  42.7  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000924748  normal  0.134467 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4125  cobalt transport protein  26.8 
 
 
217 aa  42.4  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.902173  hitchhiker  0.0000589617 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2654  cobalt transport protein  26.09 
 
 
231 aa  42.4  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.36556  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>