28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4253 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_4253  cobalt transport protein  100 
 
 
226 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0091  cobalt transport protein  98.67 
 
 
226 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4448  cobalt transport protein  98.67 
 
 
226 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4308  cobalt transport protein  98.23 
 
 
226 aa  440  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3865  cobalt transport protein  83.7 
 
 
227 aa  352  4e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3958  cobalt transport protein  82.82 
 
 
227 aa  348  4e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0133  cobalt transport protein  65.19 
 
 
230 aa  236  3e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0096  cobalt transport protein  55.56 
 
 
221 aa  228  7e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4086  cobalt transport protein  54.67 
 
 
223 aa  223  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3674  cobalt transport protein  52.86 
 
 
217 aa  180  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0133  hypothetical protein  42.65 
 
 
223 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1539  cobalt transport protein  34.22 
 
 
245 aa  102  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2395  ABC-type transport system, permease component  31.82 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1475  cobalt transport protein  32.64 
 
 
223 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000182828 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0077  cobalt transport protein  25 
 
 
246 aa  52  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.67532  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0253  cobalt transport protein  30 
 
 
313 aa  52  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.648323  normal  0.0540671 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1836  cobalt transport protein  22.54 
 
 
244 aa  47  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.507525  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0589  ABC-type cobalt transport system  28 
 
 
258 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0946935  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3444  cobalt transport protein  29.69 
 
 
265 aa  46.6  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1760  cobalt transport protein  25.37 
 
 
291 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1788  cobalt transport protein  25.37 
 
 
291 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.121417  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2654  cobalt transport protein  26.2 
 
 
231 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.36556  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0314  cobalt transport protein  30.11 
 
 
250 aa  42.7  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.892766  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0260  hypothetical protein  22.76 
 
 
266 aa  42.4  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.79252  normal  0.480643 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0682  cobalt transport protein  27.84 
 
 
248 aa  42.4  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000924748  normal  0.134467 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  26.97 
 
 
257 aa  42.4  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3823  cobalt transport protein  27.91 
 
 
266 aa  42  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457934  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12800  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  25.17 
 
 
256 aa  42  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>