74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5272 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_5361  cobalt transport protein  100 
 
 
258 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5272  cobalt transport protein  100 
 
 
258 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5651  cobalt transport protein  99.61 
 
 
258 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.263565  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0972  cobalt transport protein  73.58 
 
 
249 aa  317  9e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0821  cobalt ABC transporter permease  44.21 
 
 
275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.505848  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3649  cobalt transport protein  45.93 
 
 
266 aa  172  6.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0414  cobalt transport protein  45.16 
 
 
895 aa  169  3e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.624811 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3864  cobalt transport protein  43.5 
 
 
267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3444  cobalt transport protein  44.31 
 
 
265 aa  149  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3823  cobalt transport protein  42.86 
 
 
266 aa  145  6e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457934  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2044  cobalt transport protein  42.26 
 
 
264 aa  123  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25955  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0589  ABC-type cobalt transport system  42.4 
 
 
258 aa  116  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0946935  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0253  cobalt transport protein  43.78 
 
 
313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.648323  normal  0.0540671 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4235  cobalt transport protein  34.45 
 
 
294 aa  90.1  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1972  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  27.51 
 
 
275 aa  69.7  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08030  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  33.03 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2710  cobalt transport protein  22.62 
 
 
266 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2669  cobalt transport protein  22.58 
 
 
266 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00761496  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2386  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  21.3 
 
 
287 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00268022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2425  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  22.48 
 
 
287 aa  60.1  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2659  cobalt transport protein  22.48 
 
 
266 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000035997 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2642  cobalt transport protein  22.02 
 
 
273 aa  58.9  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.357292  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2462  cobalt transport protein  22.02 
 
 
287 aa  58.5  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0609  cobalt transport protein  27.36 
 
 
261 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0066  cobalt transport protein  34.17 
 
 
238 aa  58.2  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07620  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  27.72 
 
 
276 aa  57.4  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23320  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  35.4 
 
 
811 aa  56.6  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1413  cobalt transport protein  29.19 
 
 
260 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2667  cobalt transport protein  23.15 
 
 
266 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2657  cobalt transport protein  23.04 
 
 
266 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.287835  hitchhiker  0.000000289223 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  33.33 
 
 
764 aa  54.3  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12800  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  26.25 
 
 
256 aa  54.3  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  26.45 
 
 
267 aa  53.5  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1834  putative cobalt ABC transporter, permease protein  22.46 
 
 
273 aa  53.5  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  23.94 
 
 
273 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11750  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  36.57 
 
 
656 aa  52  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.348562  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  28.49 
 
 
267 aa  51.6  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  27.92 
 
 
270 aa  51.2  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2485  cobalt transport protein  24.84 
 
 
256 aa  51.2  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.08544  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  34.78 
 
 
263 aa  49.7  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1632  cobalt transport family protein  29.45 
 
 
276 aa  49.3  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0712  cobalt transport protein  32.84 
 
 
243 aa  49.3  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  22.92 
 
 
264 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  22.92 
 
 
264 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  22.08 
 
 
264 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  22.08 
 
 
264 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  22.08 
 
 
264 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  22.08 
 
 
264 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  22.08 
 
 
264 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  32.03 
 
 
264 aa  47  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  25.54 
 
 
266 aa  47  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0091  cobalt transport protein  28.49 
 
 
258 aa  47  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0139648  normal  0.284452 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1800  cobalt transport protein  30 
 
 
279 aa  46.2  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  22.08 
 
 
264 aa  46.2  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05107  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ  25.97 
 
 
279 aa  46.2  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2498  cobalt transport protein  26.13 
 
 
266 aa  45.8  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0348  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  30.63 
 
 
276 aa  45.8  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001241  transmembrane component MtsC of energizing module of methionine-regulated ECF transporter  25.97 
 
 
279 aa  45.8  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529253  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  22.08 
 
 
264 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  25.53 
 
 
267 aa  45.4  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  22.08 
 
 
264 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  21.67 
 
 
264 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  26.49 
 
 
310 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  26.16 
 
 
268 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  25.58 
 
 
268 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  26.24 
 
 
265 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1539  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  24.83 
 
 
278 aa  44.3  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.173972  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1990  putative cobalt transport protein  27.92 
 
 
279 aa  43.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024453  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2764  cobalt transport protein  26.42 
 
 
277 aa  42.7  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2707  cobalt transport protein  26.42 
 
 
277 aa  42.7  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  26.78 
 
 
268 aa  42.7  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  28.63 
 
 
265 aa  42.7  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1302  cobalt transport protein  23.78 
 
 
267 aa  42.7  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0789486  normal  0.0436887 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  26.09 
 
 
257 aa  42.7  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>