70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_08030 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_08030  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  100 
 
 		 267 aa  496  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0091  cobalt transport protein  44.31 
 
 		 258 aa  182  3e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0139648  normal  0.284452 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23320  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  53.6 
 
 		 811 aa  157  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3444  cobalt transport protein  38.52 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3823  cobalt transport protein  40.62 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457934  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2044  cobalt transport protein  36.33 
 
 		 264 aa  89.4  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07520  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  33.78 
 
 		 270 aa  89  8e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.508014 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3649  cobalt transport protein  31.75 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0589  ABC-type cobalt transport system  32.86 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0946935  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3864  cobalt transport protein  32.41 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1413  cobalt transport protein  31.56 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5361  cobalt transport protein  33.03 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2020  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.57 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000160433  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5272  cobalt transport protein  33.03 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5651  cobalt transport protein  33.03 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.263565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2657  cobalt transport protein  25.38 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.287835  hitchhiker  0.000000289223 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2667  cobalt transport protein  26.52 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0609  cobalt transport protein  33.77 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2710  cobalt transport protein  26.15 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2669  cobalt transport protein  26.15 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00761496  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0660  cobalt transport family protein  23.42 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.11691  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1632  cobalt transport family protein  26.35 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2498  cobalt transport protein  26.15 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0972  cobalt transport protein  33.33 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1135  cobalt transport protein  22.97 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1157  cobalt transport protein  22.97 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  25.85 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2386  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  23.57 
 
 		 287 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00268022  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  24 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2659  cobalt transport protein  23.85 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000035997 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2642  cobalt transport protein  23.85 
 
 		 273 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.357292  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2704  cobalt transport protein  24.29 
 
 		 285 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2425  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  23.85 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434651  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0821  cobalt ABC transporter permease  27.91 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.505848  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2462  cobalt transport protein  23.85 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0414  cobalt transport protein  27.88 
 
 		 895 aa  52  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.624811 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  27.85 
 
 		 764 aa  52  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  21.37 
 
 		 267 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0247  cobalt transport protein  28.98 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.224698  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001241  transmembrane component MtsC of energizing module of methionine-regulated ECF transporter  25 
 
 		 279 aa  50.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529253  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05107  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ  25.54 
 
 		 279 aa  47.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0095  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  21.32 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0929  cobalt transport protein  25.94 
 
 		 271 aa  47.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000291148  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0260  hypothetical protein  24.82 
 
 		 266 aa  47  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.79252  normal  0.480643 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0348  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  25.52 
 
 		 276 aa  46.6  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1353  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  33.33 
 
 		 253 aa  45.8  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3136  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.51 
 
 		 255 aa  45.8  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0712  cobalt transport protein  27.47 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0318  cobalt transport protein  24.37 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000082775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  25.1 
 
 		 262 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  23.89 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  23.89 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  27.23 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2707  cobalt transport protein  22.95 
 
 		 277 aa  45.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2764  cobalt transport protein  22.95 
 
 		 277 aa  45.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1501  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  22.68 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12580  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  28.12 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  31.18 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0951  cobalt transport protein  25.26 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.222726  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2186  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.81 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00517893 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  25 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  22.53 
 
 		 263 aa  43.5  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2148  cobalt transport protein  27.49 
 
 		 260 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0253  cobalt transport protein  31.68 
 
 		 313 aa  43.5  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.648323  normal  0.0540671 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1990  putative cobalt transport protein  26.72 
 
 		 279 aa  43.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024453  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1539  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  26.85 
 
 		 278 aa  42.7  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.173972  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0766  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  24.62 
 
 		 213 aa  42.7  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.156344  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5234  cobalt transport protein  27.75 
 
 		 283 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0162  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.3 
 
 		 252 aa  42.4  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.227232  normal  0.133608 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0578  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.34 
 
 		 254 aa  42  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.852275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>