25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0766 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0766  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  100 
 
 
213 aa  430  1e-120  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.156344  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1488  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  67.15 
 
 
213 aa  290  1e-77  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.308498  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1543  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  40.37 
 
 
222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.690869  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0071  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  40.28 
 
 
217 aa  149  3e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00121752  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0172  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  37.37 
 
 
216 aa  145  5e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1663  cobalt transport protein  38.89 
 
 
217 aa  138  7e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0838  hypothetical protein  27.14 
 
 
233 aa  74.3  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.103141  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0609  cobalt transport protein  27.15 
 
 
261 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0828  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  31.72 
 
 
255 aa  53.9  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.404494  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0589  ABC-type cobalt transport system  26.4 
 
 
258 aa  49.3  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0946935  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3823  cobalt transport protein  31.51 
 
 
266 aa  48.9  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457934  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  28.81 
 
 
764 aa  48.9  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3444  cobalt transport protein  33.07 
 
 
265 aa  48.1  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07520  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  26.34 
 
 
270 aa  48.1  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.508014 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  33.02 
 
 
267 aa  47.8  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0414  cobalt transport protein  27.86 
 
 
895 aa  47.8  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.624811 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0821  cobalt ABC transporter permease  25.33 
 
 
275 aa  45.8  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.505848  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  27.88 
 
 
264 aa  45.8  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2044  cobalt transport protein  28 
 
 
264 aa  45.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25955  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2669  cobalt transport protein  26.41 
 
 
266 aa  45.1  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00761496  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2710  cobalt transport protein  26.84 
 
 
266 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3101  cobalt transport protein  24.77 
 
 
233 aa  42.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.486493  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1768  ABC transporter, permease protein  27.08 
 
 
297 aa  42.4  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.689624  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1413  cobalt transport protein  29.63 
 
 
260 aa  42.4  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0253  cobalt transport protein  30.25 
 
 
313 aa  41.6  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.648323  normal  0.0540671 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>