168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1922 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1922  cobalt transport protein  100 
 
 		 221 aa  432  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.493439  hitchhiker  0.00315513 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4125  cobalt transport protein  78.5 
 
 		 217 aa  297  8e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.902173  hitchhiker  0.0000589617 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2440  cobalt transport protein  40.31 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.542686  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0712  cobalt transport protein  30.67 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  31.34 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1879  cobalt transport protein  27.93 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.200735  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0226  cobalt transport protein  29.68 
 
 		 262 aa  67  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1545  cobalt transport protein  32.59 
 
 		 276 aa  67  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.679113  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0370  cobalt transport protein  29.56 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1800  cobalt transport protein  34.15 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  26.86 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  30.73 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  26.03 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  23.85 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3887  cobalt transport protein  28.89 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000020913  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2667  cobalt transport protein  25.33 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  27.85 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  32.68 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3451  cobalt transport protein  27.54 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0951  cobalt transport protein  25.3 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.222726  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  32.17 
 
 		 310 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4408  cobalt transport protein  28.99 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.371368  normal  0.0141186 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  25.11 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  24.36 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2657  cobalt transport protein  24.32 
 
 		 266 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.287835  hitchhiker  0.000000289223 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0929  cobalt transport protein  23.62 
 
 		 271 aa  54.7  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000291148  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2498  cobalt transport protein  26.14 
 
 		 266 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4171  cobalt transport protein  29.86 
 
 		 249 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00476195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  26.97 
 
 		 265 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3551  cobalt ABC transporter, permease protein  26.79 
 
 		 287 aa  53.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401892  normal  0.225242 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0682  cobalt transport protein  31.79 
 
 		 248 aa  53.1  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000924748  normal  0.134467 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12800  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  31.93 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  28.29 
 
 		 264 aa  52.8  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3687  cobalt transport protein  30.67 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.600557  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0091  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.29 
 
 		 310 aa  52.8  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4597  cobalt transport protein  28.91 
 
 		 244 aa  52.8  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0314465 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0077  cobalt transport protein  25.12 
 
 		 246 aa  52.8  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.67532  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  31.82 
 
 		 263 aa  52  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  31.82 
 
 		 263 aa  52  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2669  cobalt transport protein  24.59 
 
 		 266 aa  52  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00761496  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2710  cobalt transport protein  24.59 
 
 		 266 aa  52  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.1 
 
 		 770 aa  51.6  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  32.61 
 
 		 264 aa  51.2  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2115  cobalt transport protein  30.09 
 
 		 268 aa  50.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.990281  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  25.43 
 
 		 270 aa  50.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2386  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  23.01 
 
 		 287 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00268022  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  28.39 
 
 		 264 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2623  hypothetical protein  29.63 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  27.33 
 
 		 264 aa  50.1  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1257  cobalt transport protein  29.85 
 
 		 259 aa  50.1  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000290738  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  27.46 
 
 		 263 aa  49.7  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2044  cobalt transport protein  29.41 
 
 		 264 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2563  cobalt transport protein  25.56 
 
 		 293 aa  49.7  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.121483 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1964  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit  32.71 
 
 		 255 aa  49.7  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  28 
 
 		 264 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05107  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ  25 
 
 		 279 aa  49.3  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2485  cobalt transport protein  27.69 
 
 		 256 aa  49.7  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.08544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  24.35 
 
 		 273 aa  49.3  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0132  cobalt transport protein  26.41 
 
 		 273 aa  48.9  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  28.39 
 
 		 264 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2111  cobalt transport protein  28.57 
 
 		 253 aa  48.5  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.105406  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  27.74 
 
 		 264 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  27.74 
 
 		 264 aa  48.5  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  27.74 
 
 		 264 aa  48.5  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  27.74 
 
 		 264 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  27.74 
 
 		 264 aa  48.5  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  27.74 
 
 		 264 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0260  hypothetical protein  27.03 
 
 		 266 aa  48.5  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.79252  normal  0.480643 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  27.74 
 
 		 264 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001241  transmembrane component MtsC of energizing module of methionine-regulated ECF transporter  25 
 
 		 279 aa  48.5  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529253  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1834  putative cobalt ABC transporter, permease protein  23.13 
 
 		 273 aa  48.1  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2659  cobalt transport protein  22.3 
 
 		 266 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000035997 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2462  cobalt transport protein  23.01 
 
 		 287 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2425  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  23.01 
 
 		 287 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434651  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0583  cobalt transport family protein  29.41 
 
 		 257 aa  47.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2642  cobalt transport protein  23.01 
 
 		 273 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.357292  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1788  cobalt transport protein  28.83 
 
 		 291 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.121417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1760  cobalt transport protein  28.83 
 
 		 291 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3101  cobalt transport protein  28.57 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.486493  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1990  putative cobalt transport protein  23.24 
 
 		 279 aa  47.8  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024453  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19680  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  26.67 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0554754  normal  0.221391 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  29.86 
 
 		 268 aa  47  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  28.98 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2654  cobalt transport protein  26.72 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.36556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3865  cobalt transport protein  28.12 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3318  ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.427182  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2704  cobalt transport protein  23.39 
 
 		 285 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07620  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  29.06 
 
 		 276 aa  47  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  34.58 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1539  cobalt transport protein  30.63 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25720  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  28.15 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01470  Cobalt transport protein  34.07 
 
 		 350 aa  47.4  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0260035  normal  0.244881 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1913  ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 268 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2319  hypothetical protein  30.2 
 
 		 155 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf374  cobalt ABC transporter, permease protein  29.52 
 
 		 314 aa  47.4  0.0002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004205  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3338  ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 268 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0462941  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3246  ABC transporter permease  30.91 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.867562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  29.91 
 
 		 265 aa  47.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3106  cobalt ABC transporter, permease  28.57 
 
 		 292 aa  46.6  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3365  ABC transporter permease  28.57 
 
 		 292 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>