147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3451 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3451  cobalt transport protein  100 
 
 		 261 aa  496  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4408  cobalt transport protein  82.75 
 
 		 260 aa  410  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.371368  normal  0.0141186 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2111  cobalt transport protein  38.65 
 
 		 253 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.105406  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1894  cobalt transport protein  35.86 
 
 		 244 aa  132  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.154103  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1257  cobalt transport protein  33.97 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000290738  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  30.51 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1652  cobalt transport protein  32.93 
 
 		 275 aa  78.6  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.761015  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1645  cobalt transport protein  32.93 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020196 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  30.43 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  28.05 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3887  cobalt transport protein  25.71 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000020913  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0929  cobalt transport protein  27.03 
 
 		 271 aa  72  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000291148  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1501  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  25.89 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  25.19 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3551  cobalt ABC transporter, permease protein  26.09 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401892  normal  0.225242 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0951  cobalt transport protein  26.88 
 
 		 271 aa  68.6  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.222726  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  29.17 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1632  cobalt transport family protein  27.04 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1046  cobalt transport protein  24.31 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0226  cobalt transport protein  28.79 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0348  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  33.33 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1879  cobalt transport protein  27.03 
 
 		 252 aa  67  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.200735  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1834  putative cobalt ABC transporter, permease protein  24.89 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  31.85 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  31.85 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  30.06 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12800  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  30.64 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2498  cobalt transport protein  31.13 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  27.21 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1539  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  23.68 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.173972  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1800  cobalt transport protein  30.53 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3444  cobalt transport protein  30.91 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07520  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  25.45 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.508014 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  22.64 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1947  cobalt ABC transporter permease protein  29.54 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.259406  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2707  cobalt transport protein  30.84 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2764  cobalt transport protein  30.84 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2704  cobalt transport protein  25.93 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1972  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  30.56 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05107  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ  25.38 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  22.26 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1990  putative cobalt transport protein  29.13 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024453  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  24.68 
 
 		 268 aa  62  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  24.68 
 
 		 268 aa  62  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001241  transmembrane component MtsC of energizing module of methionine-regulated ECF transporter  29 
 
 		 279 aa  62  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529253  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07620  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  26.16 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0007  cobalt transport protein  26.58 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  24.36 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0369  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  27.78 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3649  cobalt transport protein  27.68 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  29.31 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1545  cobalt transport protein  30.16 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.679113  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  31.03 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1693  cobalt transport protein  27.51 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0637761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5234  cobalt transport protein  24.17 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  26.97 
 
 		 332 aa  58.5  0.00000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  27.8 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  24.03 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0260  hypothetical protein  27.17 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.79252  normal  0.480643 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2667  cobalt transport protein  29.91 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  28.57 
 
 		 810 aa  58.2  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  25.69 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  24.43 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  24.28 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0370  cobalt transport protein  25.32 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  30.46 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3067  hypothetical protein  27.94 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0427863 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0027  hypothetical protein  27.52 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2485  cobalt transport protein  28.8 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.08544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2657  cobalt transport protein  28.97 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.287835  hitchhiker  0.000000289223 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0629  cobalt transport protein  32.32 
 
 		 438 aa  55.8  0.0000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.35082  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  28.46 
 
 		 268 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  27.42 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2462  cobalt transport protein  28.04 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2425  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  28.3 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2642  cobalt transport protein  28.04 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.357292  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2659  cobalt transport protein  28.04 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000035997 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3355  hypothetical protein  26.81 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.587862  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3415  ABC transporter permease  30.41 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.119505 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2669  cobalt transport protein  28.04 
 
 		 266 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00761496  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2386  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  28.04 
 
 		 287 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00268022  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0712  cobalt transport protein  30 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1535  cobalt transport protein  28.8 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.811853  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  25.36 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  24.03 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1302  cobalt transport protein  32.48 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0789486  normal  0.0436887 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3260  hypothetical protein  26.81 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.763278  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  29.25 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3310  ABC transporter permease  30.41 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3246  ABC transporter permease  30.41 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.867562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2710  cobalt transport protein  28.04 
 
 		 266 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3313  ABC transporter permease protein  29.5 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4227  hypothetical protein  27.69 
 
 		 235 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  23.64 
 
 		 264 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3235  ABC transporter permease protein  29.5 
 
 		 235 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1950  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporters-like protein  26.67 
 
 		 241 aa  52.8  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  23.26 
 
 		 264 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  23.26 
 
 		 264 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  23.26 
 
 		 264 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1760  cobalt transport protein  20.16 
 
 		 291 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>