54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3415 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A3415  ABC transporter permease  100 
 
 		 235 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.119505 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3310  ABC transporter permease  98.72 
 
 		 235 aa  457  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3313  ABC transporter permease protein  98.72 
 
 		 235 aa  457  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3246  ABC transporter permease  98.3 
 
 		 235 aa  454  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.867562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3235  ABC transporter permease protein  98.3 
 
 		 235 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4227  hypothetical protein  82.55 
 
 		 235 aa  400  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3067  hypothetical protein  83.4 
 
 		 235 aa  403  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0427863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3355  hypothetical protein  82.55 
 
 		 235 aa  399  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.587862  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3260  hypothetical protein  82.98 
 
 		 235 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.763278  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1894  cobalt transport protein  35.19 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.154103  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1608  cobalt transport protein  29.1 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1693  cobalt transport protein  28.28 
 
 		 265 aa  62  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0637761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2822  cobalt transport protein  30 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2111  cobalt transport protein  30.53 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.105406  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1257  cobalt transport protein  24.43 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000290738  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1652  cobalt transport protein  30.77 
 
 		 275 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.761015  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3451  cobalt transport protein  30.41 
 
 		 261 aa  55.1  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1302  cobalt transport protein  28.33 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0789486  normal  0.0436887 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0027  hypothetical protein  27.5 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2498  cobalt transport protein  24.42 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0598  cobalt transport protein  28.47 
 
 		 261 aa  53.5  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157547  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2704  cobalt transport protein  23.64 
 
 		 285 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4408  cobalt transport protein  27.74 
 
 		 260 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.371368  normal  0.0141186 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1800  cobalt transport protein  27.78 
 
 		 279 aa  51.2  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3887  cobalt transport protein  31.31 
 
 		 270 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000020913  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2710  cobalt transport protein  22.29 
 
 		 266 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2657  cobalt transport protein  23.21 
 
 		 266 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.287835  hitchhiker  0.000000289223 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2669  cobalt transport protein  23.26 
 
 		 266 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00761496  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2667  cobalt transport protein  23.26 
 
 		 266 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1632  cobalt transport family protein  24.69 
 
 		 276 aa  46.6  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  21.9 
 
 		 259 aa  46.2  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1879  cobalt transport protein  21.09 
 
 		 252 aa  46.2  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.200735  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1645  cobalt transport protein  28.8 
 
 		 247 aa  45.1  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020196 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  27.52 
 
 		 264 aa  45.1  0.0009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2462  cobalt transport protein  22.67 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5234  cobalt transport protein  21.84 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2425  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  21.64 
 
 		 287 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434651  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2386  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  21.64 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00268022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2642  cobalt transport protein  22.67 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.357292  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0260  hypothetical protein  25.6 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.79252  normal  0.480643 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0348  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  23.2 
 
 		 276 aa  43.9  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2659  cobalt transport protein  21.64 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000035997 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  27.27 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05107  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ  24.19 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001241  transmembrane component MtsC of energizing module of methionine-regulated ECF transporter  24.19 
 
 		 279 aa  43.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529253  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  20.97 
 
 		 273 aa  42.7  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1760  cobalt transport protein  21.58 
 
 		 291 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2677  cobalt transport protein  30.36 
 
 		 287 aa  42.4  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.503395  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  23.2 
 
 		 268 aa  42.4  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  23.2 
 
 		 268 aa  42.4  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3551  cobalt ABC transporter, permease protein  28.05 
 
 		 287 aa  42  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401892  normal  0.225242 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0226  cobalt transport protein  24.48 
 
 		 262 aa  42  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4125  cobalt transport protein  34.25 
 
 		 217 aa  42  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.902173  hitchhiker  0.0000589617 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1788  cobalt transport protein  21.58 
 
 		 291 aa  41.6  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.121417  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>