34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_4227 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_4227  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3355  hypothetical protein  98.72 
 
 
235 aa  463  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.587862  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3260  hypothetical protein  98.3 
 
 
235 aa  463  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.763278  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3067  hypothetical protein  97.02 
 
 
235 aa  455  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0427863 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3313  ABC transporter permease protein  83.83 
 
 
235 aa  391  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3235  ABC transporter permease protein  82.55 
 
 
235 aa  387  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3246  ABC transporter permease  82.98 
 
 
235 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.867562  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3310  ABC transporter permease  82.98 
 
 
235 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3415  ABC transporter permease  82.55 
 
 
235 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.119505 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1894  cobalt transport protein  34.95 
 
 
244 aa  62  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.154103  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1257  cobalt transport protein  25.19 
 
 
259 aa  59.3  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000290738  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2111  cobalt transport protein  29.19 
 
 
253 aa  58.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.105406  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2704  cobalt transport protein  24.54 
 
 
285 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2822  cobalt transport protein  25.35 
 
 
261 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1608  cobalt transport protein  31.53 
 
 
262 aa  54.7  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1693  cobalt transport protein  29.25 
 
 
265 aa  53.9  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0637761  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3451  cobalt transport protein  27.69 
 
 
261 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1652  cobalt transport protein  29.1 
 
 
275 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.761015  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  22.51 
 
 
259 aa  50.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0027  hypothetical protein  25.93 
 
 
255 aa  49.7  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4408  cobalt transport protein  26.95 
 
 
260 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.371368  normal  0.0141186 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1302  cobalt transport protein  28.7 
 
 
267 aa  47.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0789486  normal  0.0436887 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2498  cobalt transport protein  21.76 
 
 
266 aa  45.4  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1645  cobalt transport protein  28.8 
 
 
247 aa  45.4  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020196 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1760  cobalt transport protein  21.89 
 
 
291 aa  45.1  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3887  cobalt transport protein  32.04 
 
 
270 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000020913  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1800  cobalt transport protein  28.46 
 
 
279 aa  44.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5234  cobalt transport protein  26.87 
 
 
283 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1788  cobalt transport protein  21.89 
 
 
291 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.121417  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  25.76 
 
 
310 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0598  cobalt transport protein  27.35 
 
 
261 aa  44.3  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157547  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1879  cobalt transport protein  21.88 
 
 
252 aa  43.5  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.200735  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0260  hypothetical protein  25.76 
 
 
266 aa  42.7  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.79252  normal  0.480643 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  21.77 
 
 
273 aa  42.7  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>