35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3355 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E3355  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.587862  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3260  hypothetical protein  99.57 
 
 		 235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.763278  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4227  hypothetical protein  98.72 
 
 		 235 aa  463  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3067  hypothetical protein  96.6 
 
 		 235 aa  453  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0427863 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3313  ABC transporter permease protein  83.83 
 
 		 235 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3235  ABC transporter permease protein  82.55 
 
 		 235 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3246  ABC transporter permease  82.98 
 
 		 235 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.867562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3310  ABC transporter permease  82.98 
 
 		 235 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3415  ABC transporter permease  82.55 
 
 		 235 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.119505 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1894  cobalt transport protein  34.95 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.154103  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1257  cobalt transport protein  25.19 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000290738  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2111  cobalt transport protein  29.85 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.105406  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1693  cobalt transport protein  28.74 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0637761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2704  cobalt transport protein  24.54 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1652  cobalt transport protein  28.75 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.761015  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1608  cobalt transport protein  31.53 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2822  cobalt transport protein  24.88 
 
 		 261 aa  54.3  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3451  cobalt transport protein  26.81 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0027  hypothetical protein  26.98 
 
 		 255 aa  50.1  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  22.92 
 
 		 259 aa  50.1  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4408  cobalt transport protein  26.95 
 
 		 260 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.371368  normal  0.0141186 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1302  cobalt transport protein  28.7 
 
 		 267 aa  48.5  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0789486  normal  0.0436887 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1800  cobalt transport protein  28.46 
 
 		 279 aa  46.2  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  25.76 
 
 		 310 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0598  cobalt transport protein  28.21 
 
 		 261 aa  46.2  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157547  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2498  cobalt transport protein  22.3 
 
 		 266 aa  45.8  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3887  cobalt transport protein  32.04 
 
 		 270 aa  45.8  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000020913  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1645  cobalt transport protein  28.8 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020196 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1879  cobalt transport protein  21.88 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.200735  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1760  cobalt transport protein  21.89 
 
 		 291 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  21.77 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1788  cobalt transport protein  21.34 
 
 		 291 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.121417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0260  hypothetical protein  25.76 
 
 		 266 aa  42.7  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.79252  normal  0.480643 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5234  cobalt transport protein  25.93 
 
 		 283 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1104  cobalt transport protein  31.73 
 
 		 274 aa  42  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>