55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1104 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1104  cobalt transport protein  100 
 
 
274 aa  521  1e-147  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  31.06 
 
 
259 aa  61.2  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  26.7 
 
 
264 aa  59.3  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  26.67 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1760  cobalt transport protein  25.34 
 
 
291 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1788  cobalt transport protein  25.34 
 
 
291 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.121417  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  26.44 
 
 
269 aa  53.9  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  25.22 
 
 
264 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  25.22 
 
 
264 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  25.22 
 
 
264 aa  53.1  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  25.22 
 
 
264 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  25.22 
 
 
264 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  25.22 
 
 
264 aa  52.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1950  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporters-like protein  26.4 
 
 
241 aa  52  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  25.22 
 
 
264 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  25.23 
 
 
270 aa  52  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0629  cobalt transport protein  24.49 
 
 
438 aa  51.6  0.00002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.35082  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0712  cobalt transport protein  28.21 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  24.78 
 
 
264 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  24.78 
 
 
264 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  25.61 
 
 
267 aa  50.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  24.78 
 
 
264 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0260  hypothetical protein  23.48 
 
 
266 aa  49.7  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.79252  normal  0.480643 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  25.66 
 
 
264 aa  48.5  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1990  putative cobalt transport protein  33.33 
 
 
279 aa  47.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024453  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1800  cobalt transport protein  29.2 
 
 
279 aa  47.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07620  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  28.25 
 
 
276 aa  47.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2485  cobalt transport protein  26.39 
 
 
256 aa  47.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.08544  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  22.9 
 
 
268 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  27.23 
 
 
263 aa  46.6  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  27.23 
 
 
263 aa  46.6  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  22.9 
 
 
268 aa  46.2  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  25.39 
 
 
269 aa  46.6  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  26.32 
 
 
268 aa  46.2  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  22.44 
 
 
310 aa  45.8  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0337  cobalt transport protein  25.51 
 
 
256 aa  45.4  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001241  transmembrane component MtsC of energizing module of methionine-regulated ECF transporter  30.07 
 
 
279 aa  45.4  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529253  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3473  cobalt transport protein  27.1 
 
 
259 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1243  cobalt transport protein  25.93 
 
 
301 aa  44.7  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1879  cobalt transport protein  26.36 
 
 
252 aa  45.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.200735  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05107  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ  27.94 
 
 
279 aa  45.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3444  cobalt transport protein  26.99 
 
 
265 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1535  cobalt transport protein  37.1 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.811853  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1045  cobalt transport protein  33.54 
 
 
308 aa  45.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2799  cobalt transport protein  27.72 
 
 
284 aa  44.3  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161091  hitchhiker  0.0000401783 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2498  cobalt transport protein  29.41 
 
 
266 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  24.87 
 
 
262 aa  43.9  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5234  cobalt transport protein  23.5 
 
 
283 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12800  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  26.53 
 
 
256 aa  43.1  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  27.78 
 
 
266 aa  43.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  25 
 
 
268 aa  43.5  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2704  cobalt transport protein  22.13 
 
 
285 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  26.09 
 
 
266 aa  43.1  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0369  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  27.23 
 
 
273 aa  42.4  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1597  transporter, putative  21.67 
 
 
235 aa  42.4  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>