108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1045 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1045  cobalt transport protein  100 
 
 
308 aa  622  1e-177  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1457  cobalt transport protein  37.17 
 
 
309 aa  179  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0562  cobalt transport protein  37.25 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0105073  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2677  cobalt transport protein  32.99 
 
 
287 aa  149  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.503395  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  29.64 
 
 
310 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3009  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  26.6 
 
 
292 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3106  cobalt ABC transporter, permease  28.12 
 
 
292 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3119  ABC transporter permease  28.91 
 
 
292 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3365  ABC transporter permease  28.91 
 
 
292 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3324  ABC transporter, permease protein  26.5 
 
 
292 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3318  ABC transporter, permease protein  27.35 
 
 
267 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.427182  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3338  ABC transporter, permease protein  28.63 
 
 
268 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3044  cobalt transport protein  27.64 
 
 
294 aa  91.3  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3338  ABC transporter, permease protein  27.78 
 
 
268 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0462941  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1913  ABC transporter, permease protein  27.35 
 
 
268 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2115  cobalt transport protein  28.39 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.990281  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  26.69 
 
 
268 aa  77.4  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1028  hypothetical protein  30.09 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3800  cobalt transport protein  27.35 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0120159  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1243  cobalt transport protein  25.37 
 
 
301 aa  73.6  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  28.29 
 
 
266 aa  72  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0027  hypothetical protein  28.91 
 
 
255 aa  72.4  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  29.27 
 
 
264 aa  71.6  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  28.74 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2822  cobalt transport protein  25.21 
 
 
261 aa  68.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  25.47 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  26.85 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  25.68 
 
 
268 aa  64.3  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  25.28 
 
 
269 aa  63.5  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  29.1 
 
 
267 aa  63.5  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1800  cobalt transport protein  29.22 
 
 
279 aa  61.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0666  cobalt ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 
336 aa  60.8  0.00000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1693  cobalt transport protein  26.19 
 
 
265 aa  60.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0637761  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04640  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  25.32 
 
 
299 aa  58.9  0.00000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  25.1 
 
 
266 aa  58.5  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  24.6 
 
 
259 aa  57.4  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  26.89 
 
 
267 aa  57.4  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1302  cobalt transport protein  23.67 
 
 
267 aa  57  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0789486  normal  0.0436887 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  28.28 
 
 
268 aa  56.6  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  28.28 
 
 
268 aa  56.6  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  31.19 
 
 
265 aa  56.6  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1608  cobalt transport protein  26.38 
 
 
262 aa  56.2  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1834  putative cobalt ABC transporter, permease protein  24.51 
 
 
273 aa  56.2  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  34.83 
 
 
265 aa  56.6  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0712  cobalt transport protein  28.67 
 
 
243 aa  55.8  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  24.4 
 
 
267 aa  55.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  26.53 
 
 
332 aa  54.7  0.000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3811  cobalt transport protein  28.99 
 
 
396 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0159545  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1990  putative cobalt transport protein  30.56 
 
 
279 aa  54.3  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024453  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2175  cobalt transport protein  25.23 
 
 
374 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.706888 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf374  cobalt ABC transporter, permease protein  27.83 
 
 
314 aa  53.9  0.000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004205  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  24.85 
 
 
264 aa  53.9  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  28.29 
 
 
264 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2044  cobalt transport protein  22.75 
 
 
264 aa  53.5  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25955  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  28.29 
 
 
264 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1501  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  21.69 
 
 
293 aa  53.1  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3431  cobalt transport protein  31.11 
 
 
374 aa  53.1  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2667  cobalt transport protein  26.55 
 
 
266 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1972  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  23.83 
 
 
275 aa  52.8  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  27.91 
 
 
264 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  27.91 
 
 
264 aa  52.8  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  27.91 
 
 
264 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  27.91 
 
 
264 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0598  cobalt transport protein  27.2 
 
 
261 aa  52.8  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157547  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  27.91 
 
 
264 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  30 
 
 
263 aa  52.8  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  30 
 
 
263 aa  52.8  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0989  hypothetical protein  23.49 
 
 
304 aa  52.4  0.000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.154887  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  24.86 
 
 
266 aa  52.4  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  26.53 
 
 
269 aa  52.4  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  23.11 
 
 
273 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07620  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  24.32 
 
 
276 aa  52  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1950  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporters-like protein  27.41 
 
 
241 aa  51.2  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1702  cobalt transport protein  26.24 
 
 
265 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1545  cobalt transport protein  24.54 
 
 
276 aa  50.8  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.679113  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  33.64 
 
 
264 aa  50.8  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  32.58 
 
 
265 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0828  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  24.38 
 
 
255 aa  50.4  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.404494  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05107  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ  36 
 
 
279 aa  50.4  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0629  cobalt transport protein  25.25 
 
 
438 aa  50.4  0.00004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.35082  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  27.76 
 
 
264 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  29.81 
 
 
264 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001241  transmembrane component MtsC of energizing module of methionine-regulated ECF transporter  36 
 
 
279 aa  50.1  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529253  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1257  cobalt transport protein  24.89 
 
 
259 aa  49.7  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000290738  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  27.52 
 
 
264 aa  49.7  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0951  cobalt transport protein  25.1 
 
 
271 aa  49.7  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.222726  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0260  hypothetical protein  25.17 
 
 
266 aa  49.3  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.79252  normal  0.480643 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  27.52 
 
 
269 aa  48.9  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  30.72 
 
 
264 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0320  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  36.56 
 
 
267 aa  48.1  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00398229  hitchhiker  1.85295e-17 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0929  cobalt transport protein  24.8 
 
 
271 aa  48.1  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000291148  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1632  cobalt transport family protein  22.05 
 
 
276 aa  47.4  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4408  cobalt transport protein  23.5 
 
 
260 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.371368  normal  0.0141186 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0247  cobalt transport protein  30.48 
 
 
269 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.224698  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1894  cobalt transport protein  28.7 
 
 
244 aa  46.6  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.154103  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2657  cobalt transport protein  24.86 
 
 
266 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.287835  hitchhiker  0.000000289223 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  23.46 
 
 
267 aa  46.2  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1104  cobalt transport protein  33.54 
 
 
274 aa  45.8  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  23.87 
 
 
268 aa  45.8  0.0009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1879  cobalt transport protein  22.73 
 
 
252 aa  45.8  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.200735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>