23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_04640 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_04640  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  100 
 
 
299 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1028  hypothetical protein  42.42 
 
 
291 aa  195  6e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0989  hypothetical protein  29.93 
 
 
304 aa  130  4.0000000000000003e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.154887  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3106  cobalt ABC transporter, permease  26.14 
 
 
292 aa  99.8  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3119  ABC transporter permease  26.14 
 
 
292 aa  99  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3365  ABC transporter permease  26.14 
 
 
292 aa  99  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3324  ABC transporter, permease protein  25.82 
 
 
292 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3009  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  26.3 
 
 
292 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3044  cobalt transport protein  25.83 
 
 
294 aa  92.8  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3338  ABC transporter, permease protein  26.18 
 
 
268 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0462941  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3338  ABC transporter, permease protein  25.82 
 
 
268 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3318  ABC transporter, permease protein  25.82 
 
 
267 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.427182  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1913  ABC transporter, permease protein  24 
 
 
268 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2677  cobalt transport protein  25.82 
 
 
287 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.503395  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2115  cobalt transport protein  24.36 
 
 
268 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.990281  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1045  cobalt transport protein  25.46 
 
 
308 aa  60.8  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0562  cobalt transport protein  25 
 
 
309 aa  53.1  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0105073  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1457  cobalt transport protein  26.15 
 
 
309 aa  50.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  25 
 
 
273 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1834  putative cobalt ABC transporter, permease protein  25 
 
 
273 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  21.81 
 
 
259 aa  43.1  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  21.11 
 
 
268 aa  42.7  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  21.11 
 
 
268 aa  42.7  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>