13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0989 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0989  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  617  1e-176  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.154887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04640  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  29.93 
 
 		 299 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1028  hypothetical protein  27.57 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0562  cobalt transport protein  29.44 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0105073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2677  cobalt transport protein  24.06 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.503395  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3044  cobalt transport protein  21.05 
 
 		 294 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3106  cobalt ABC transporter, permease  19.5 
 
 		 292 aa  49.7  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3324  ABC transporter, permease protein  19.49 
 
 		 292 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1045  cobalt transport protein  24.69 
 
 		 308 aa  49.3  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3009  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  17.97 
 
 		 292 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3119  ABC transporter permease  19.07 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3365  ABC transporter permease  19.07 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1457  cobalt transport protein  25.69 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>