17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3431 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3431  cobalt transport protein  100 
 
 		 374 aa  717    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4399  cobalt transport protein  58.26 
 
 		 382 aa  294  2e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.628473  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3110  cobalt transport protein  49.5 
 
 		 368 aa  248  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0964246  normal  0.178901 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17460  Cobalt transport protein  46.53 
 
 		 436 aa  209  9e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0915415  normal  0.293576 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2292  cobalt transport protein  51.82 
 
 		 357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00571392  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0944  cobalt transport protein  42.12 
 
 		 392 aa  145  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.269038  normal  0.36799 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2175  cobalt transport protein  31.56 
 
 		 374 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.706888 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15950  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  38.81 
 
 		 368 aa  119  9e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.277345  normal  0.332753 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3811  cobalt transport protein  30.32 
 
 		 396 aa  113  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0159545  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3624  ABC transporter related  42.59 
 
 		 966 aa  77.4  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  27.69 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3343  ABC transporter related  41.98 
 
 		 960 aa  56.2  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1045  cobalt transport protein  30.43 
 
 		 308 aa  52.8  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0027  hypothetical protein  24.9 
 
 		 255 aa  52.8  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  25.35 
 
 		 267 aa  49.3  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  28.32 
 
 		 264 aa  47.8  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  22.83 
 
 		 268 aa  44.3  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>