30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_17460 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_17460  Cobalt transport protein  100 
 
 
436 aa  837    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0915415  normal  0.293576 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3431  cobalt transport protein  46.01 
 
 
374 aa  240  4e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4399  cobalt transport protein  46.99 
 
 
382 aa  226  7e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.628473  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3110  cobalt transport protein  44.86 
 
 
368 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0964246  normal  0.178901 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2292  cobalt transport protein  45.53 
 
 
357 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00571392  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2175  cobalt transport protein  35.6 
 
 
374 aa  144  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.706888 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3811  cobalt transport protein  31.58 
 
 
396 aa  131  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0159545  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0944  cobalt transport protein  43.14 
 
 
392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.269038  normal  0.36799 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15950  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  37.04 
 
 
368 aa  87.4  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.277345  normal  0.332753 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  23.89 
 
 
310 aa  50.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3624  ABC transporter related  35 
 
 
966 aa  50.4  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  26.34 
 
 
267 aa  49.7  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  23.81 
 
 
264 aa  46.6  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  24.24 
 
 
264 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0666  cobalt ABC transporter, permease protein  26.77 
 
 
336 aa  45.8  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  23.03 
 
 
264 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0027  hypothetical protein  26.48 
 
 
255 aa  45.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  23.03 
 
 
264 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  23.03 
 
 
264 aa  45.8  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  23.03 
 
 
264 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  23.03 
 
 
264 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  23.03 
 
 
264 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  23.03 
 
 
264 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  30.77 
 
 
267 aa  44.3  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1157  cobalt transport protein  27.78 
 
 
268 aa  43.9  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1135  cobalt transport protein  27.78 
 
 
268 aa  43.9  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  23.64 
 
 
264 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  36.19 
 
 
266 aa  43.9  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2822  cobalt transport protein  24.79 
 
 
261 aa  43.9  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0660  cobalt transport family protein  27.68 
 
 
279 aa  43.1  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.11691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>